目的 研究2014年上海市手足口病的病原谱,及肠道病毒A组71型(EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(CV-A 16)变异变迁规律.方法 采集上海市2014年手足口病患者的咽拭子标本,进行核酸检测,对核酸检测结果为EV-A71、CV-A16以及其他EV阳性的临床标本进行病毒分离.对病毒分离结果阳性株进行全长VP1编码区基因的扩增以及核苷酸序列的测定和分析,然后与EV-A71、CV-A16各基因型和基因亚型的代表株构建亲缘性进化树.结果 2014年上海市辖区共对2017例HFMD临床标本进行了核酸检测,共有1644例检测结果为阳性.从中随机地选择出75份临床标本接种RD细胞和Vero细胞,共有60份出现EV特征性CPE,病毒分离的阳性率为82.67％,其中23株被鉴定为EV-A71、32株被鉴定为CV-A16、5株被鉴定为其他EV.23株EV-A71全部属于C4a进化分支;32株CV-A16中,有8株属于B1a进化分支,有24株属于B1b进化分支.结论 2014年上海市辖区手足口病呈现EV-A71与CV-A16共同流行的模式.C4a进化分支的EV-A71在上海市持续传播,而Bib进化分支成为上海市CV-A16的流行优势株.研究和掌握EV-A71和CV-A16等肠道病毒流行株的基因特征,发现其变异位点和变异趋势,对HFMD预防控制策略措施的制定将有重要的参考意义.
作者：甘霖；滕峥；王嘉瑜；张勇；许文波；钟照华；张曦；严冬梅
来源：中华实验和临床病毒学杂志 2016 年 30卷 3期
