目的 为确定1株通过高通量测序获得的GV型野生鼠诺如病毒(MNV)变异株的基因组序列特征.方法 将在山东地区采集的210只鼠经解剖后收集的肠道内容物和肝脏进行核酸提取,质检合格后送于华大基因进行高通量测序,获得一株GV型野生鼠诺如病毒.设计特异性巢式引物利用RT-PCR方法扩增该病毒全基因组.利用DNAMAN,MEGA5.0软件进行序列比对及系统进化分析.结果 获得的GV型野生MNV变异株全基因组长度7 382 bp,与从数据库中选取的30株参考毒株全基因组序列相似度为76.8% ~78.1%,其中VP1中的高变区P2编码的氨基酸相似度仅为60.9% ~78.1%,表明该株MNV具有较高的变异率.结论 本研究分离出了一株野生鼠诺如病毒,丰富了国内MNV的基因库,其变异特征为了解国内MNV的分子遗传特征及进化来源提供了参考依据.
作者:刘蒙蒙;李利利;林琳;王笑峰;段招军
来源:中华实验和临床病毒学杂志 2018 年 32卷 2期