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目的 了解北京市流行的风疹病毒基因型特征和变异趋势,为风疹传染病防治工作提供科学依据.方法 选取北京市风疹实验室诊断病例咽拭子标本提取病毒核酸,采用RT-PCR方法扩增风疹病毒E1基因739个核苷酸片段,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析.同WHO风疹病毒基因型代表株构建基因进化树,分析基因型特征、核苷酸和氨基酸的变异.结果 获得10株可用于分子流行病学研究的靶核苷酸序列.在基于WHO基因定型靶序列739个核苷酸片段构建的基因进化树上,10株风疹病毒均属于2 B基因型,相对于参考株形成一个独立分支.10株风疹病毒大部分核苷酸突变为无义突变,氨基酸序列高度保守,除了1株风疹病毒在E1蛋白血凝抑制和中和位点区域第282位氨基酸发生Ser→Phe突变,其他病毒株无重要抗原位点改变.结论 北京地区发现风疹病毒2B基因型流行株.

作者:于霞丽;陈萌

来源:中华微生物学和免疫学杂志 2016 年 36卷 3期

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作者:
于霞丽;陈萌
来源:
中华微生物学和免疫学杂志 2016 年 36卷 3期
标签:
风疹病毒 基因型 进化分析 Rubella virus Genotype Phylogenetic analysis
目的 了解北京市流行的风疹病毒基因型特征和变异趋势,为风疹传染病防治工作提供科学依据.方法 选取北京市风疹实验室诊断病例咽拭子标本提取病毒核酸,采用RT-PCR方法扩增风疹病毒E1基因739个核苷酸片段,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析.同WHO风疹病毒基因型代表株构建基因进化树,分析基因型特征、核苷酸和氨基酸的变异.结果 获得10株可用于分子流行病学研究的靶核苷酸序列.在基于WHO基因定型靶序列739个核苷酸片段构建的基因进化树上,10株风疹病毒均属于2 B基因型,相对于参考株形成一个独立分支.10株风疹病毒大部分核苷酸突变为无义突变,氨基酸序列高度保守,除了1株风疹病毒在E1蛋白血凝抑制和中和位点区域第282位氨基酸发生Ser→Phe突变,其他病毒株无重要抗原位点改变.结论 北京地区发现风疹病毒2B基因型流行株.