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目的 采用串联质谱标签(TMT)联合液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)筛选和鉴定用于缺血性结肠炎(IC)与UC鉴别诊断的血清蛋白质标志物.方法 选择浙江大学医学院附属第一医院2018年1月至2019年1月收治的UC和IC患者各10例,以及健康对照者10名,分别纳入UC组、IC组和NC组.采集所有研究对象的空腹血清样本,经去除高丰度蛋白、蛋白酶解、肽段标记和分馏等处理后,通过质谱分析仪检测,获取在3组试验中均具有TMT数据且去除TMT值为0的蛋白质,构建蛋白质聚类热图,设定差异倍数>1.5或<0.67且差异有统计学意义的蛋白质为差异蛋白质.通过Reactome数据库对组间差异蛋白质所参与的通路进行聚类分析.统计学方法采用t检验、hypergeometry检验和BH多重检验校正.结果 经蛋白质谱分析,共鉴定出357种血清蛋白质.IC组与NC组比较共有27个差异蛋白质,其中上调蛋白质6个,下调蛋白质21个;UC组与NC组比较共有228个差异蛋白质,其中上调蛋白质75个,下调蛋白质153个;UC组与IC组比较共有49个差异蛋白质,其中上调蛋白质22个,下调蛋白质27个.在NC组、IC组、UC组3组的差异蛋白质比较中,仅纤维凝胶蛋白质3表达量在3组间两两比较的差异均有统计学意义(其在UC组与NC组、UC组与IC组、IC组与NC组中的差异倍数分别为0.24、0.46和0.53,t=-5.089、-7.298

作者:宁龙贵;俞静华;单国栋;孙泽宇;陈文果;章粉明;胡凤玲;陈洪潭;许国强

来源:中华消化杂志 2019 年 39卷 12期

知识库介绍

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作者:
宁龙贵;俞静华;单国栋;孙泽宇;陈文果;章粉明;胡凤玲;陈洪潭;许国强
来源:
中华消化杂志 2019 年 39卷 12期
标签:
结肠炎,缺血性 结肠炎,溃疡性 蛋白质组学 标志物,血清 Colitis,ischemic Colitis,ulcerative Proteomics Markers,serum
目的 采用串联质谱标签(TMT)联合液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)筛选和鉴定用于缺血性结肠炎(IC)与UC鉴别诊断的血清蛋白质标志物.方法 选择浙江大学医学院附属第一医院2018年1月至2019年1月收治的UC和IC患者各10例,以及健康对照者10名,分别纳入UC组、IC组和NC组.采集所有研究对象的空腹血清样本,经去除高丰度蛋白、蛋白酶解、肽段标记和分馏等处理后,通过质谱分析仪检测,获取在3组试验中均具有TMT数据且去除TMT值为0的蛋白质,构建蛋白质聚类热图,设定差异倍数>1.5或<0.67且差异有统计学意义的蛋白质为差异蛋白质.通过Reactome数据库对组间差异蛋白质所参与的通路进行聚类分析.统计学方法采用t检验、hypergeometry检验和BH多重检验校正.结果 经蛋白质谱分析,共鉴定出357种血清蛋白质.IC组与NC组比较共有27个差异蛋白质,其中上调蛋白质6个,下调蛋白质21个;UC组与NC组比较共有228个差异蛋白质,其中上调蛋白质75个,下调蛋白质153个;UC组与IC组比较共有49个差异蛋白质,其中上调蛋白质22个,下调蛋白质27个.在NC组、IC组、UC组3组的差异蛋白质比较中,仅纤维凝胶蛋白质3表达量在3组间两两比较的差异均有统计学意义(其在UC组与NC组、UC组与IC组、IC组与NC组中的差异倍数分别为0.24、0.46和0.53,t=-5.089、-7.298