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目的 了解安庆市人与猪群中流行的戊型肝炎病毒(hepatitis E Virus,HEV)的基因型和系统进化特征.方法 收集安庆市27份散发戊型肝炎患者血清标本和400份商品猪胆汁标本,并根据采样时间将猪胆汁标本分为A、B、C、D等4组(每组各100份).应用巢氏逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)方法检测HEV开放式阅读框架(open reading frame,ORF)2区域内150 nt序列,测序后与GenBank下载的参考病毒株序列进行比对,并计算核苷酸序列间的同源性.使用贝叶斯推断法构建系统进化树,分析安庆市人与猪群中HEV的基因型和系统进化关系.结果 患者的男女性别比例为2.86∶1,平均年龄为56.78岁.27份患者血清标本中有16份检出HEV RNA,阳性检出率为59.26

作者:夏玉刚;胡安群;陆一涵;刘海燕;郑英杰

来源:中华预防医学杂志 2010 年 44卷 10期

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作者:
夏玉刚;胡安群;陆一涵;刘海燕;郑英杰
来源:
中华预防医学杂志 2010 年 44卷 10期
标签:
肝炎病毒,戊型 基因型 进化 序列分析 Hepatitis E virus Genotype Evolution Sequence analysis
目的 了解安庆市人与猪群中流行的戊型肝炎病毒(hepatitis E Virus,HEV)的基因型和系统进化特征.方法 收集安庆市27份散发戊型肝炎患者血清标本和400份商品猪胆汁标本,并根据采样时间将猪胆汁标本分为A、B、C、D等4组(每组各100份).应用巢氏逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)方法检测HEV开放式阅读框架(open reading frame,ORF)2区域内150 nt序列,测序后与GenBank下载的参考病毒株序列进行比对,并计算核苷酸序列间的同源性.使用贝叶斯推断法构建系统进化树,分析安庆市人与猪群中HEV的基因型和系统进化关系.结果 患者的男女性别比例为2.86∶1,平均年龄为56.78岁.27份患者血清标本中有16份检出HEV RNA,阳性检出率为59.26