目的 对分离自新疆散发戊型肝炎(戊肝)患者的1株戊型肝炎病毒(HEV) W2-1全基因组序列进行测定和分析.方法 应用RT-PCR分段扩增的方法获得W2-1的全长基因组序列;通过与GenBank中HEV代表株相比较,对其进行分型和基因同源性分析.结果 W2-1全长7212 nt,5'和3'UTR以及3个开放读码框(ORF1~3)分别为27、28、5079、1980和345 nt.序列分析表明,W2-1属于基因1型1b亚型,与引起1986-1989年新疆戊肝流行的HEV序列同源性为97.2%~ 98.5%,与2000-2008年我国分离到的1b亚型HEV同源性为97.6%~ 99.2%;其ORF1 ~3蛋白序列中含有区别于3型和4型HEV的特异性氨基酸位点.结论 W2-1属于1b亚型,新疆戊肝大流行之后1b亚型在我国人群中仍有传播,并且其基因序列稳定.
作者:耿彦生;马红霞;赵晨燕;黄维金;王佑春
来源:中华微生物学和免疫学杂志 2013 年 33卷 6期