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目的 分析宁夏回族自治区(宁夏)手足口病病例中柯萨奇病毒A10型(CV-A10)分离株的基因特征.方法 于2013年1月-2014年12月,利用手足口病实验室网络监测系统,采集宁夏各市、县到当地人民医院就诊的手足口病病例标本,共采集2470份,其中粪便标本450份,咽拭子2 020份.使用人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离,获得的各种毒株用兼并引物进行VP1区基因扩增和序列测定.测序结果利用Blast进行病毒型别鉴定后,对鉴定为CV-A10的所有毒株进行同源性和系统进化分析.结果 共收集到非EV-A71和非CV-A16的肠道病毒标本450份,分离到CV-A10 36株,其中,2013年6株,2014年30株.36株毒株间的核苷酸和氨基酸同源性分别为90.6%~ 100.0%和90.2%~ 100.0%.与A、B、C、D各型别代表株的同源性比较发现,36株毒株与C型代表株的核苷酸和氨基酸同源性最高,分别为90.2%~ 98.9%和95.7%~ 99.7%.系统进化分析显示,36株宁夏CV-A10分离株与C基因型代表株处于同一分支.结论 CV-A10是引起宁夏地区手足口病的常见病原体,本次分离到的CV-A10均属于C基因型,具有较宽的同源性范围.

作者:马江涛;袁芳;林虹;陈慧;马学旻;詹军

来源:中华预防医学杂志 2015 年 49卷 12期

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作者:
马江涛;袁芳;林虹;陈慧;马学旻;詹军
来源:
中华预防医学杂志 2015 年 49卷 12期
标签:
手足口病 生物学监测 柯萨奇病毒感染 基因型 Hand,foot and mouth disease Biosurveillance Coxsackievirus infections Genotype
目的 分析宁夏回族自治区(宁夏)手足口病病例中柯萨奇病毒A10型(CV-A10)分离株的基因特征.方法 于2013年1月-2014年12月,利用手足口病实验室网络监测系统,采集宁夏各市、县到当地人民医院就诊的手足口病病例标本,共采集2470份,其中粪便标本450份,咽拭子2 020份.使用人横纹肌肉瘤细胞进行病毒分离,获得的各种毒株用兼并引物进行VP1区基因扩增和序列测定.测序结果利用Blast进行病毒型别鉴定后,对鉴定为CV-A10的所有毒株进行同源性和系统进化分析.结果 共收集到非EV-A71和非CV-A16的肠道病毒标本450份,分离到CV-A10 36株,其中,2013年6株,2014年30株.36株毒株间的核苷酸和氨基酸同源性分别为90.6%~ 100.0%和90.2%~ 100.0%.与A、B、C、D各型别代表株的同源性比较发现,36株毒株与C型代表株的核苷酸和氨基酸同源性最高,分别为90.2%~ 98.9%和95.7%~ 99.7%.系统进化分析显示,36株宁夏CV-A10分离株与C基因型代表株处于同一分支.结论 CV-A10是引起宁夏地区手足口病的常见病原体,本次分离到的CV-A10均属于C基因型,具有较宽的同源性范围.