目的 建立HLA-DPB1基因第2~3外显子测序方法,并分析其多态性.方法 根据HLA-DPB1基因序列,设计位点特异性引物扩增242名浙江汉族人群HLA-DPB1第2~3外显子序列,PCR扩增产物经双酶切后对第2和3外显子进行双向测序分析,采用Assign 3.5+SBT分析软件判读HLA-DPB1等位基因型.结果 PCR扩增获得特异性的单一目的片段,其产物经直接测序后得到清晰的序列图.242名浙江汉族人群中共检测到18个HLA-DPB1等位基因,频率超过0.05的等位基因为DPB1*05:01:01/135:01(0.4112)、DPB1*02:01:02(0.1901)、DPB1*04:01:01(0.1136)以及DPB1 *02:02(0.0620),并确认1个新等位基因DPB1*168:01.在第3外显子中发现9个多态性位点,其中517 A>T为本实验新检出的1个多态性位点.结论 本实验建立的HLA-DPB1第2~3外显子测序方法是可行的,HLA-DPB1第3外显子存在一定多态性.
作者:和艳敏;陶苏丹;章伟;王炜;何吉;朱发明;吕杭军
来源:中华医学遗传学杂志 2015 年 32卷 1期