目的：调查一株泛耐药鲍氏不动杆菌流行株的遗传学背景，为耐药菌的快速诊断提供参考。方法泛耐药鲍氏不动杆菌WA2859分离自2010年3月住院患者痰液标本，作 gyrA与parC基因测序、BLASTn比对确认为鲍氏不动杆菌，采用Illumina HiSeq与Ion Torrent PGM 两种大规模并行测序仪进行全基因组分析，再进行人工测序补缺口，并进行了特定基因分析（包含β‐内酰胺类、氨基糖苷类抗菌药物获得耐药基因，ISaba1‐blaADC、ISaba1‐blaOXA‐23连锁检测）。结果泛耐药鲍氏不动杆菌WA2859株全基因组测序未获完整序列，得到一条推定的染色体序列，长3887116 bp（内含两个缺口）；推定的质粒序列，长260513 bp（内含9个缺口）；特定基因检出blaT EM、blaA DC、blaOX A‐23β‐内酰胺类抗菌药物获得耐药基因和 aac（6′）‐Ⅰ b、ant（3′）‐Ⅰ、ant（2″）‐Ⅰ、ap h （3′）‐Ⅰ氨基糖苷类抗菌药物获得耐药基因，并且 ISaba1‐blaADC、ISaba1‐blaOXA‐23连锁检测均阳性。结论特定基因检测与全基因组测序互为补充，对特定基因检测结果作样本聚类分析并可得到菌株亲缘关系结果，可对临床分离的耐药细菌作快速诊断和分子流行病学研究。
作者：许亚丰；王春新；赵琪；糜祖煌；翁幸鐾
来源：中华医院感染学杂志 2015 年 22期
