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目的 比较114例甲状腺乳头状癌(PTC)不同亚型体细胞基因突变与癌症基因组图谱(TCGA)数据库的差异.方法 选择南京医科大学第一附属医院治疗的114例PTC病例,对其甲状腺术后组织采用二代测序技术检测甲状腺癌相关的18个热点基因;通过cBioPortal网站下载TCGA数据库PTC相关资料,比较114例PTC病例体细胞基因突变与TCGA数据库的差异.结果 114例PTC病例中,女性73例,占64.04%,年龄为(39.23±13.18)岁.114例PTC病例BRAF V600E、TERTp、PDGFRA、PTEN和TP53突变率分别为66.67%、3.51%、1.75%、3.51%和4.39%,高于TCGA数据库的48.68%、0.41%、0%、0.41%和0.61%(P<0.05).在不同亚型中,经典型PTC病例的BRAF V600E、TP53和TSHR突变率分别为80.88%、7.35%和2.94%,滤泡型PTC病例的BRAF V600E、TERTp突变率分别为36.84%和10.53%,均高于TCGA数据库的54.99%、0.57%、0%、13.86%和0%(P<0.05).按美国甲状腺协会甲状腺癌复发风险分层,经典型中危组PTC病例BRAF V600E、TP53突变率分别为77.14%和8.57%,滤泡型低危组PTC的BRAF V600E突变率为27.27%,中危组的TERTp突变率为33.33%,均高于TCGA数据库的55.10%、0%、3.28%和0%(P<0.05).结论 纳入比较分析的114例PTC病例体细胞基因突变类型和突变率与TCGA数

作者:曹星月;方海生;李霄;沈美萍;武晓泓

来源:预防医学 2023 年 35卷 2期

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作者:
曹星月;方海生;李霄;沈美萍;武晓泓
来源:
预防医学 2023 年 35卷 2期
标签:
甲状腺乳头状癌 病理亚型 TCGA数据库 基因突变
目的 比较114例甲状腺乳头状癌(PTC)不同亚型体细胞基因突变与癌症基因组图谱(TCGA)数据库的差异.方法 选择南京医科大学第一附属医院治疗的114例PTC病例,对其甲状腺术后组织采用二代测序技术检测甲状腺癌相关的18个热点基因;通过cBioPortal网站下载TCGA数据库PTC相关资料,比较114例PTC病例体细胞基因突变与TCGA数据库的差异.结果 114例PTC病例中,女性73例,占64.04%,年龄为(39.23±13.18)岁.114例PTC病例BRAF V600E、TERTp、PDGFRA、PTEN和TP53突变率分别为66.67%、3.51%、1.75%、3.51%和4.39%,高于TCGA数据库的48.68%、0.41%、0%、0.41%和0.61%(P<0.05).在不同亚型中,经典型PTC病例的BRAF V600E、TP53和TSHR突变率分别为80.88%、7.35%和2.94%,滤泡型PTC病例的BRAF V600E、TERTp突变率分别为36.84%和10.53%,均高于TCGA数据库的54.99%、0.57%、0%、13.86%和0%(P<0.05).按美国甲状腺协会甲状腺癌复发风险分层,经典型中危组PTC病例BRAF V600E、TP53突变率分别为77.14%和8.57%,滤泡型低危组PTC的BRAF V600E突变率为27.27%,中危组的TERTp突变率为33.33%,均高于TCGA数据库的55.10%、0%、3.28%和0%(P<0.05).结论 纳入比较分析的114例PTC病例体细胞基因突变类型和突变率与TCGA数