您的账号已在其他设备登录,您当前账号已强迫下线,
如非您本人操作,建议您在会员中心进行密码修改

确定
收藏 | 浏览62 | 下载13

目的 研究基于单样本基因富集分析(ssGSEA)分型构建肺腺癌的风险预测模型的价值.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库及基因表达数据库(GEO)中分别获取515例及116例肺腺癌患者的数据.基于TCGA数据库进行ssGSEA分析及聚类分析,将样本分为高免疫评分组和低免疫评分组,并进行免疫相关分析、富集分析及差异分析,进一步获得免疫相关的差异表达基因.将TCGA数据集患者以7:3随机分为训练集和内部验证集.基于TCGA训练集的免疫相关差异表达基因数据,通过单因素Cox风险回归、套索算法(Lasso)回归以及多元逐步Cox风险回归分析降维,构建肺腺癌患者预后的预测模型,获得相应的风险分数(Riskscore),并用TCGA内部验证集及GEO外部验证集进行验证.将Riskscore与临床特征进行独立预后因素分析,建立列线图.ROC曲线与校正曲线分析分别用来评估模型的效能及拟合度.结果 根据患者样本的ssGSEA免疫评分、聚类分析及差异分析的结果,患者被分为高免疫评分组和低免疫评分组以及获得1447个差异表达基因.再通过单因素Cox风险回归、Lasso回归以及多元逐步Cox风险回归分析降维,获得剩余8个预后相关免疫差异表达基因的最优集合和每例患者的Risks-core.该风险预测模型在训练集、内部验证集及外部验证集的AUC分别为0.703、0.713、0.750.根据独

作者:高晨;吴林玉;孔宁;娄新璟;郭勇;许茂盛

来源:浙江医学 2022 年 44卷 16期

知识库介绍

临床诊疗知识库该平台旨在解决临床医护人员在学习、工作中对医学信息的需求,方便快速、便捷的获取实用的医学信息,辅助临床决策参考。该库包含疾病、药品、检查、指南规范、病例文献及循证文献等多种丰富权威的临床资源。

详细介绍
热门关注
免责声明:本知识库提供的有关内容等信息仅供学习参考,不代替医生的诊断和医嘱。

收藏
| 浏览:62 | 下载:13
作者:
高晨;吴林玉;孔宁;娄新璟;郭勇;许茂盛
来源:
浙江医学 2022 年 44卷 16期
标签:
肺腺癌 癌症基因组图谱 预后 生物学标志物 单样本基因富集分析
目的 研究基于单样本基因富集分析(ssGSEA)分型构建肺腺癌的风险预测模型的价值.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库及基因表达数据库(GEO)中分别获取515例及116例肺腺癌患者的数据.基于TCGA数据库进行ssGSEA分析及聚类分析,将样本分为高免疫评分组和低免疫评分组,并进行免疫相关分析、富集分析及差异分析,进一步获得免疫相关的差异表达基因.将TCGA数据集患者以7:3随机分为训练集和内部验证集.基于TCGA训练集的免疫相关差异表达基因数据,通过单因素Cox风险回归、套索算法(Lasso)回归以及多元逐步Cox风险回归分析降维,构建肺腺癌患者预后的预测模型,获得相应的风险分数(Riskscore),并用TCGA内部验证集及GEO外部验证集进行验证.将Riskscore与临床特征进行独立预后因素分析,建立列线图.ROC曲线与校正曲线分析分别用来评估模型的效能及拟合度.结果 根据患者样本的ssGSEA免疫评分、聚类分析及差异分析的结果,患者被分为高免疫评分组和低免疫评分组以及获得1447个差异表达基因.再通过单因素Cox风险回归、Lasso回归以及多元逐步Cox风险回归分析降维,获得剩余8个预后相关免疫差异表达基因的最优集合和每例患者的Risks-core.该风险预测模型在训练集、内部验证集及外部验证集的AUC分别为0.703、0.713、0.750.根据独