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[目的]基于网络药理学探讨白花蛇舌草-半枝莲药对治疗肝细胞癌的潜在靶点及作用机制.[方法]利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索白花蛇舌草和半枝莲活性成分,导入Drugbank数据库进行蛋白靶点匹配,使用GeneCards数据库、 人类在线孟德尔遗传(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)数据库、 治疗目标数据库(Therapeutic Target Database,TTD)、Drugbank、肝细胞癌肿瘤数据库(Oncogenomic Database of Hepatocellular Carcinoma,OncoDB.HCC)和Liverome数据库等获取肝细胞癌相关靶点,运用Cytoscape构建"药物-活性成分-靶点"网络,String数据库构建蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并通过网络拓扑分析筛选关键成分及核心靶点,最后利用R语言及Cluego对预测得到的核心靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析.[结果]白花蛇舌草-半枝莲药治疗肝细胞癌的潜在靶点89个,通过网络拓扑分析筛选得到6个核心靶点、5种关键成分.GO功能富集分析显示,白花蛇舌草-半枝莲药对主要参与细胞增殖、细胞凋亡、炎症反应和血管

作者:李索咪;徐辉辉;朱均晶;舒琦瑾

来源:浙江中医药大学学报 2020 年 44卷 11期

知识库介绍

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李索咪;徐辉辉;朱均晶;舒琦瑾
来源:
浙江中医药大学学报 2020 年 44卷 11期
标签:
白花蛇舌草 半枝莲 活性成分 靶点 肝细胞癌 网络药理学 信号通路 作用机制
[目的]基于网络药理学探讨白花蛇舌草-半枝莲药对治疗肝细胞癌的潜在靶点及作用机制.[方法]利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索白花蛇舌草和半枝莲活性成分,导入Drugbank数据库进行蛋白靶点匹配,使用GeneCards数据库、 人类在线孟德尔遗传(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)数据库、 治疗目标数据库(Therapeutic Target Database,TTD)、Drugbank、肝细胞癌肿瘤数据库(Oncogenomic Database of Hepatocellular Carcinoma,OncoDB.HCC)和Liverome数据库等获取肝细胞癌相关靶点,运用Cytoscape构建"药物-活性成分-靶点"网络,String数据库构建蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并通过网络拓扑分析筛选关键成分及核心靶点,最后利用R语言及Cluego对预测得到的核心靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析.[结果]白花蛇舌草-半枝莲药治疗肝细胞癌的潜在靶点89个,通过网络拓扑分析筛选得到6个核心靶点、5种关键成分.GO功能富集分析显示,白花蛇舌草-半枝莲药对主要参与细胞增殖、细胞凋亡、炎症反应和血管