目的 探讨肝细胞癌(HCC)患者免疫相关基因特征的潜在预后生物标志物.方法 从TCGA数据库下载原始肝细胞癌数据,执行单样本基因集富集分析计算每个样本的免疫活性.利用"GSVA"包和"hclust"包将HCC样本分成高和低免疫细胞浸润组.ESTIMATE算法对每个HCC样本中的肿瘤微环境进行评分."limma"包和维恩图确定有效的免疫相关基因.单因素Cox、LASSO回归和多因素Cox回归分析探索关键基因."rms"包建立列线图并绘制校准曲线.结果 与高免疫细胞浸润组相比,低免疫细胞浸润组中样本的肿瘤纯度更高,免疫评分、ESTIMATE评分和基质评分较低.高免疫细胞浸润组免疫成分更丰富,TIGIT、PD-L1、PD-1、LAG3、TIM-3、CTLA4和HLA家族的表达水平更高.多因素Cox回归分析显示4个免疫相关基因(S100A9、HMOX1、IL18RAP和FCER1G)被用来构建预后模型.与其他临床特征相比,该预后模型的风险评分被确认为独立的预后因素.结论 本研究确定了肝细胞癌免疫相关核心基因,可用于肝细胞癌的靶向治疗和免疫治疗.
作者:王珏;金宗睿;王维;易麒麟;王继龙;朱海;徐邦浩;郭雅;文张
来源:肿瘤防治研究 2022 年 49卷 6期