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目的 探讨锌转运体LIV-1基因mRNA在肝癌组织中的表达及意义. 方法 对TCGA数据库中肝癌数据集的LIV-1基因的表达进行分析,采用逆转录PCR方法检测23例肝癌患者癌组织及其癌旁组织的LIV-1基因的mRNA表达水平进行验证.利用Kaplan Meier Plotter数据(http://kmplot.com/analysis/)中的肝癌数据集进行在线生存分析.通过生物信息学方法分析LIV-1基因启动子区的甲基化水平. 结果 TCGA数据库分析结果显示LIV-1 mRNA在肝癌组织中的表达显著高于正常肝脏组织(P<0.01),组织样本验证了生物信息学分析结果.相对于LIV-1低表达的肝癌患者,高表达LIV-1的肝癌患者的预后差(P<0.001).相对于正常肝组织,LIV-1基因启动子区在肝癌组织中呈低甲基化(P<0.01). 结论 异常高表达的LIV-1基因可能参与了肝癌的进展,是一种预后不良的因素.LIV-1基因启动子区低甲基化可能导致了其异常高表达.

作者:吴文婧;韩少山;陈葳;李旭;赵乐

来源:山西医科大学学报 2019 年 50卷 6期

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作者:
吴文婧;韩少山;陈葳;李旭;赵乐
来源:
山西医科大学学报 2019 年 50卷 6期
标签:
肝细胞癌 LIV-1 TCGA数据库 预后 甲基化
目的 探讨锌转运体LIV-1基因mRNA在肝癌组织中的表达及意义. 方法 对TCGA数据库中肝癌数据集的LIV-1基因的表达进行分析,采用逆转录PCR方法检测23例肝癌患者癌组织及其癌旁组织的LIV-1基因的mRNA表达水平进行验证.利用Kaplan Meier Plotter数据(http://kmplot.com/analysis/)中的肝癌数据集进行在线生存分析.通过生物信息学方法分析LIV-1基因启动子区的甲基化水平. 结果 TCGA数据库分析结果显示LIV-1 mRNA在肝癌组织中的表达显著高于正常肝脏组织(P<0.01),组织样本验证了生物信息学分析结果.相对于LIV-1低表达的肝癌患者,高表达LIV-1的肝癌患者的预后差(P<0.001).相对于正常肝组织,LIV-1基因启动子区在肝癌组织中呈低甲基化(P<0.01). 结论 异常高表达的LIV-1基因可能参与了肝癌的进展,是一种预后不良的因素.LIV-1基因启动子区低甲基化可能导致了其异常高表达.