[目的]利用基因芯片重注释寻找肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)术后复发相关lncRNA(long non-coding RNA).[方法]首先利用生物信息的方式重新注释35/41例复发/未复发HCC病例的基因表达谱数据,筛查与HCC术后复发相关的差异表达lncRNA.然后利用ROC曲线评价差异lncRNA的术后复发预测效能.最后利用基因共表达网络与功能富集分析探究差异lncRNA具体的生物学功能.[结果]差异表达分析发现3个lncRNA(LINC00342,LINC00607,LINC01553)显著差异表达[|log(fold change)|＞1,q value＜0.05].ROC曲线分析发现该3个差异lncRNA的AUC值为0.693.基因共表达网络分析发现LINC00342相关共表达网络显著富集到“细胞周期”相关功能;LINC00607相关的共表达网络中基因主要富集到“炎症反应”与“免疫反应”相关的生物学功能与通路;LINC01553相关的共表达网络中基因主要富集到“DNA复制与修复”相关的生物学功能与通路.[结论]3个lncRNA与HCC术后复发显著相关,可作为一种潜在的诊断标志物组合,值得进一步的挖掘与研究.
作者：曾玮；陈平
来源：肿瘤学杂志 2017 年 23卷 8期
