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目的:筛选非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)患者癌组织及癌旁组织中差异性表达的环状RNA (circRNA),探讨circRNA在NMIBC发病中的作用.方法:利用高通量芯片测序技术检测5例NMIBC患者癌组织及癌旁组织circRNA表达谱,筛选出差异表达的circRNA,并对其进行生物信息学分析.结果:与癌旁组织相比,癌组织标本内共有315条circRNA异常表达(上调158条,下调157条).通过miRanda(3.3a)软件对差异表达量上调和下调的前10位circRNA的miRNA结合位点进行逐条预测,提示上述差异表达circRNA可能通过分子海绵吸附作用影响NMIBC的发生与发展,其分别参与ATP的合成、钙离子调控或细胞膜功能的调控、BCRA1基因的转录调控和脂质代谢等生物过程.结论:NMIBC患者中circRNA表达谱发生了显著变化,hsa_circ_0004045、hsa_circ_0006328、hsa_circ_0000837、hsa_circ_0002229可能通过海绵吸附作用调控相应的miRNA表达,在NMIBC的发生和发展中发挥重要作用.

作者:何宇辉;邓益森;彭畔新;王爱军;张晓云;李俊杰;周晓峰

来源:中日友好医院学报 2018 年 32卷 3期

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作者:
何宇辉;邓益森;彭畔新;王爱军;张晓云;李俊杰;周晓峰
来源:
中日友好医院学报 2018 年 32卷 3期
标签:
非肌层浸润性膀胱癌 环状RNA 生物信息学 non-muscle-invasive bladder cancer circular RNA bioinformatics
目的:筛选非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)患者癌组织及癌旁组织中差异性表达的环状RNA (circRNA),探讨circRNA在NMIBC发病中的作用.方法:利用高通量芯片测序技术检测5例NMIBC患者癌组织及癌旁组织circRNA表达谱,筛选出差异表达的circRNA,并对其进行生物信息学分析.结果:与癌旁组织相比,癌组织标本内共有315条circRNA异常表达(上调158条,下调157条).通过miRanda(3.3a)软件对差异表达量上调和下调的前10位circRNA的miRNA结合位点进行逐条预测,提示上述差异表达circRNA可能通过分子海绵吸附作用影响NMIBC的发生与发展,其分别参与ATP的合成、钙离子调控或细胞膜功能的调控、BCRA1基因的转录调控和脂质代谢等生物过程.结论:NMIBC患者中circRNA表达谱发生了显著变化,hsa_circ_0004045、hsa_circ_0006328、hsa_circ_0000837、hsa_circ_0002229可能通过海绵吸附作用调控相应的miRNA表达,在NMIBC的发生和发展中发挥重要作用.