目的:采用生物信息学方法探讨妊娠上调的非泛素性钙调蛋白激酶(PNCK)在肝癌中的表达及其与预后、免疫浸润的关系.方法:基于TCGA数据库分析PNCK mRNA在肝癌中的表达,采用Cox回归分析肝癌患者预后的危险因素,GEPIA2 数据库分析PNCK mRNA表达水平与肝癌患者中位生存时间的相关性,HPA数据库分析PNCK蛋白在肝癌组织及正常肝脏组织中的表达情况,TIMER数据库分析PNCK与肝癌组织中免疫细胞浸润程度的相关性,LinkedOmics数据库鉴定出肝癌组织中与PNCK的共表达基因,共表达基因的GO、KEGG富集分析采用DAVID数据库分析.结果:肝癌组织中PNCK mRNA 表达水平为 0.041(0.010,0.365),正常组织中PNCK mRNA表达水平为0(0,0.015)(P<0.001);50 例肝癌组织及配对的癌旁组织,肝癌组织中PNCK mRNA表达水平为0.028(0,0.194),正常组织中PNCK mRNA表达水平为0(0,0.015)(P<0.001).Cox多因素分析结果显示,PNCK mRNA表达水平(高表达)是影响肝癌患者预后的危险因素(HR =1.827,95
作者:岳明强;孙立华;郜庆祖;王昕红
来源:中西医结合肝病杂志 2023 年 33卷 10期