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目的 观察重症肌无力(MG)患者血清microRNA-146a水平变化,并采用生物信息学方法分析microRNA-146a在MG发病中的分子调控网络.方法 选取初诊MG患者108例(MG组)及同期体检健康者50例(对照组),采用RT-PCR法检测血清microRNA-146a.采用UCSC基因组在线工具分析microRNA-146a在人类基因组中的位置及保守性,采用Targetscan和Co MeTa数据库预测microRNA-146a的交集靶基因,采用DAVID数据库分析microRNA-146a靶基因的功能富集(GO富集)和信号通路富集(KEGG Pathway).结果 MG组血清microRNA-146a相对水平为2.13±0.63,高于对照组的0.86±0.38(P<0.05);microRNA-146a核苷酸序列具有高度保守性,其潜在靶基因有ERBB4、NUMB、CD80、TRAF6、IRAK1等88种;GO富集结果显示,microRNA-146a靶基因功能主要富集于细胞增殖调控、神经元分化、磷代谢反应、免疫炎症反应、细胞因子合成等过程;KEGG Pathway结果显示,microR-NA-146a靶基因主要富集于Toll样受体信号通路、神经递质调节信号通路、EB信号通路等.结论 MG患者血清microRNA-146a水平升高,其可通过作用于多条信号通路参与MG的发病.

作者:黄攀;徐敏;何晓英;王淳

来源:山东医药 2018 年 58卷 48期

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作者:
黄攀;徐敏;何晓英;王淳
来源:
山东医药 2018 年 58卷 48期
标签:
重症肌无力 微小RNA-146a 生物信息学分析 靶基因 功能富集 信号通路富集 myasthenia gravis microRNA-146a bioinformatics analysis target gene functional enrichment signal pathway enrichment
目的 观察重症肌无力(MG)患者血清microRNA-146a水平变化,并采用生物信息学方法分析microRNA-146a在MG发病中的分子调控网络.方法 选取初诊MG患者108例(MG组)及同期体检健康者50例(对照组),采用RT-PCR法检测血清microRNA-146a.采用UCSC基因组在线工具分析microRNA-146a在人类基因组中的位置及保守性,采用Targetscan和Co MeTa数据库预测microRNA-146a的交集靶基因,采用DAVID数据库分析microRNA-146a靶基因的功能富集(GO富集)和信号通路富集(KEGG Pathway).结果 MG组血清microRNA-146a相对水平为2.13±0.63,高于对照组的0.86±0.38(P<0.05);microRNA-146a核苷酸序列具有高度保守性,其潜在靶基因有ERBB4、NUMB、CD80、TRAF6、IRAK1等88种;GO富集结果显示,microRNA-146a靶基因功能主要富集于细胞增殖调控、神经元分化、磷代谢反应、免疫炎症反应、细胞因子合成等过程;KEGG Pathway结果显示,microR-NA-146a靶基因主要富集于Toll样受体信号通路、神经递质调节信号通路、EB信号通路等.结论 MG患者血清microRNA-146a水平升高,其可通过作用于多条信号通路参与MG的发病.