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目的 通过网络药理学方法研究植物雌激素类中药单体治疗心肌缺血再灌注损伤(MIRI)的作用机制和潜在靶点.方法 通过检索PubMed、中国知网全文数据库(CNKI),在植物雌激素范畴内查找已通过实验验证的对心肌缺血再灌注损伤有积极干预作用的中药单体;通过PharmMapper数据库查询相关中药单体的靶点;利用GeneCard、OMIM数据库筛选疾病靶点;通过R语言绘制Venn图找到交集靶点;用Cytoscape 3.6.1软件绘制中药单体与交集靶点的网络图;用STRING数据库和Cytoscape 3.6.1绘制蛋白相互作用(PPI)网络图;利用R语言进行基因本体(GO)功能富集和京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路分析.结果 检索得到10个植物雌激素类中药单体,分别是染料木素、槲皮素、三七皂苷R1、白藜芦醇、葛根素、丹参酮ⅡA、人参皂苷Rb1、人参皂苷Rb3、人参皂苷Re、人参皂苷Rg1.获得中药单体靶点515个、疾病靶点1069个,通过Venn图得到交集靶点57个.PPI示核心靶点有血清清蛋白(ALB)、表皮生长因子受体(EGFR)、胱天蛋白酶3(CASP3)、丝裂原激活的蛋白激酶1(MAPK1)等12个,GO富集分析主要涉及与内肽酶活性、核受体活性、配体激活转录因子活性等生物过程有关,KEGG富集分析主要涉及雌激素信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化、细胞凋亡、白细胞介素-17(I

作者:王禹萌;寿鑫甜;范宗静;崔杰;薛栋华;吴旸

来源:中西医结合心脑血管病杂志 2022 年 20卷 7期

知识库介绍

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作者:
王禹萌;寿鑫甜;范宗静;崔杰;薛栋华;吴旸
来源:
中西医结合心脑血管病杂志 2022 年 20卷 7期
标签:
心肌缺血再灌注损伤 植物雌激素 网络药理学 作用机制
目的 通过网络药理学方法研究植物雌激素类中药单体治疗心肌缺血再灌注损伤(MIRI)的作用机制和潜在靶点.方法 通过检索PubMed、中国知网全文数据库(CNKI),在植物雌激素范畴内查找已通过实验验证的对心肌缺血再灌注损伤有积极干预作用的中药单体;通过PharmMapper数据库查询相关中药单体的靶点;利用GeneCard、OMIM数据库筛选疾病靶点;通过R语言绘制Venn图找到交集靶点;用Cytoscape 3.6.1软件绘制中药单体与交集靶点的网络图;用STRING数据库和Cytoscape 3.6.1绘制蛋白相互作用(PPI)网络图;利用R语言进行基因本体(GO)功能富集和京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路分析.结果 检索得到10个植物雌激素类中药单体,分别是染料木素、槲皮素、三七皂苷R1、白藜芦醇、葛根素、丹参酮ⅡA、人参皂苷Rb1、人参皂苷Rb3、人参皂苷Re、人参皂苷Rg1.获得中药单体靶点515个、疾病靶点1069个,通过Venn图得到交集靶点57个.PPI示核心靶点有血清清蛋白(ALB)、表皮生长因子受体(EGFR)、胱天蛋白酶3(CASP3)、丝裂原激活的蛋白激酶1(MAPK1)等12个,GO富集分析主要涉及与内肽酶活性、核受体活性、配体激活转录因子活性等生物过程有关,KEGG富集分析主要涉及雌激素信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化、细胞凋亡、白细胞介素-17(I