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目的:借助生物信息学技术分析GEO数据库中新型冠状病毒感染心肌细胞的基因表达数据,尝试探究其分子机制,并预测治疗的潜在中药.方法:在GEO数据库中获得新型冠状病毒感染心肌细胞的基因表达谱数据集GSE185602,利用Excel软件进行分析,筛选差异基因,并进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,筛选核心基因.对差异基因进行富集分析,获得相关信号通路.结合核心基因和信号通路分析疾病的分子机制.将核心基因与coremine medica数据库映射,获得治疗的潜在中药.结果:研究获得差异基因共 232 个,其中上调基因 128 个、下调基因 92 个,富集分析获得 20 条信号通路,映射到潜在治疗中药 65 味.结论:本研究发现新型冠状病毒感染患者继发心肌损伤可能参与补体和凝血级联、细胞色素P450(Cytochrome P450,CYP)代谢异生素和磷脂酰肌醇 3 激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(RAC-alpha Serine/Threonine-protein Kinase,Akt)信号通路发生,多种中药可具有潜在治疗作用,注意随证选用.

作者:宋金香;张念志

来源:中医临床研究 2023 年 15卷 8期

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作者:
宋金香;张念志
来源:
中医临床研究 2023 年 15卷 8期
标签:
GEO数据库 新型冠状病毒感染 心肌损伤 中药预测 生物信息学
目的:借助生物信息学技术分析GEO数据库中新型冠状病毒感染心肌细胞的基因表达数据,尝试探究其分子机制,并预测治疗的潜在中药.方法:在GEO数据库中获得新型冠状病毒感染心肌细胞的基因表达谱数据集GSE185602,利用Excel软件进行分析,筛选差异基因,并进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,筛选核心基因.对差异基因进行富集分析,获得相关信号通路.结合核心基因和信号通路分析疾病的分子机制.将核心基因与coremine medica数据库映射,获得治疗的潜在中药.结果:研究获得差异基因共 232 个,其中上调基因 128 个、下调基因 92 个,富集分析获得 20 条信号通路,映射到潜在治疗中药 65 味.结论:本研究发现新型冠状病毒感染患者继发心肌损伤可能参与补体和凝血级联、细胞色素P450(Cytochrome P450,CYP)代谢异生素和磷脂酰肌醇 3 激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(RAC-alpha Serine/Threonine-protein Kinase,Akt)信号通路发生,多种中药可具有潜在治疗作用,注意随证选用.