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目的:从网络药理学的角度,研究中药海金沙治疗输尿管结石疾病的关键成分和作用机制.方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP),检索海金沙的有效成分和相关作用靶点,并利用Uniprot数据库匹配对应的基因名称;再通过GeneCards和Drugbank数据库查询获取输尿管结石疾病相关靶点,利用Cytoscape 3.9.1软件将海金沙-输尿管结石的交集靶点做网络可视化处理;通过String数据库构建相应的蛋白质-蛋白质相互作用关系图,再计算得出关键靶点基因;最后将相应的靶点基因数据通过Bioconductor数据库和R语言获得基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析各 20 条.结果:通过筛选,获得海金沙的有效成分共 11 种,海金沙与输尿管结石疾病相关的靶点共有 15 个,包括雄激素受体(Androgen Receptor,AR)、肾上腺素能受体α1β(Adrenoceptor Alpha 1B,ADRA1B)、前列腺素氧化环化酶 2(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase 2,PTGS2)、周期蛋白依赖激酶抑制因子1A(Cyclin Dependent Kinase Inhibitor 1A,CDKN1A)、肿瘤抑制蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)等;关键有效成分 5 个,包括金合欢素、香叶木素、常春藤皂苷元、β-谷甾醇、山柰酚.GO富集分析和KEGG富集分析确定各 20 条.GO分析包括生物过程、细胞组成和分

作者:蒋湘粤;赵文兵

来源:中医临床研究 2023 年 15卷 13期

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作者:
蒋湘粤;赵文兵
来源:
中医临床研究 2023 年 15卷 13期
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网络药理学 海金沙 输尿管结石 作用机制
目的:从网络药理学的角度,研究中药海金沙治疗输尿管结石疾病的关键成分和作用机制.方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP),检索海金沙的有效成分和相关作用靶点,并利用Uniprot数据库匹配对应的基因名称;再通过GeneCards和Drugbank数据库查询获取输尿管结石疾病相关靶点,利用Cytoscape 3.9.1软件将海金沙-输尿管结石的交集靶点做网络可视化处理;通过String数据库构建相应的蛋白质-蛋白质相互作用关系图,再计算得出关键靶点基因;最后将相应的靶点基因数据通过Bioconductor数据库和R语言获得基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析各 20 条.结果:通过筛选,获得海金沙的有效成分共 11 种,海金沙与输尿管结石疾病相关的靶点共有 15 个,包括雄激素受体(Androgen Receptor,AR)、肾上腺素能受体α1β(Adrenoceptor Alpha 1B,ADRA1B)、前列腺素氧化环化酶 2(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase 2,PTGS2)、周期蛋白依赖激酶抑制因子1A(Cyclin Dependent Kinase Inhibitor 1A,CDKN1A)、肿瘤抑制蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)等;关键有效成分 5 个,包括金合欢素、香叶木素、常春藤皂苷元、β-谷甾醇、山柰酚.GO富集分析和KEGG富集分析确定各 20 条.GO分析包括生物过程、细胞组成和分