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目的:基于网络药理学方法研究人参抗脓毒症的分子机制,为新药研发及中药人参的拓展应用提供理论依据.方法:通过中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)获取人参的有效成分及有效成分作用靶点;通过GeneCards、DrugBank和OMIM数据库预测脓毒症相关靶点,并运用Uniprot数据库规范靶点的基因名称,利用STRING平台进行蛋白质相互作用分析,然后采用Cytoscape3.7.2软件构建"有效成分-靶点-信号通路"相互作用网络,最后采用Metascape平台进行GO(Gene Ontology)生物功能分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集.结果:经筛选获得人参有效成分17种,人参-脓毒症交集靶点43个,其中核心靶点包括AKT1、TNF、CASP3、MAPK8、IL1 B、PTGS2、JUN、ICAM1、NOS3、VCAM1、PPARG等.GO分析获得1064条生物过程(P<0.01),KEGG富集得到102条信号通路(P<0.01),其中直接与脓毒症相关的信号通路包括TNF、NF-κB、Th17细胞分化、IL-17以及Toll样受体等信号通路.结论:人参可能通过对物质代谢、信号转导、炎症反应等多靶点及多通路的调节从而发挥抗脓毒症效应.

作者:王信林;应天昊;李晓丽;唐一迪;王艳芳;杜源;张雷明

来源:中医药信息 2021 年 38卷 3期

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作者:
王信林;应天昊;李晓丽;唐一迪;王艳芳;杜源;张雷明
来源:
中医药信息 2021 年 38卷 3期
标签:
人参 网络药理学 脓毒症 GO功能分析 KEGG通路富集
目的:基于网络药理学方法研究人参抗脓毒症的分子机制,为新药研发及中药人参的拓展应用提供理论依据.方法:通过中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)获取人参的有效成分及有效成分作用靶点;通过GeneCards、DrugBank和OMIM数据库预测脓毒症相关靶点,并运用Uniprot数据库规范靶点的基因名称,利用STRING平台进行蛋白质相互作用分析,然后采用Cytoscape3.7.2软件构建"有效成分-靶点-信号通路"相互作用网络,最后采用Metascape平台进行GO(Gene Ontology)生物功能分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路富集.结果:经筛选获得人参有效成分17种,人参-脓毒症交集靶点43个,其中核心靶点包括AKT1、TNF、CASP3、MAPK8、IL1 B、PTGS2、JUN、ICAM1、NOS3、VCAM1、PPARG等.GO分析获得1064条生物过程(P<0.01),KEGG富集得到102条信号通路(P<0.01),其中直接与脓毒症相关的信号通路包括TNF、NF-κB、Th17细胞分化、IL-17以及Toll样受体等信号通路.结论:人参可能通过对物质代谢、信号转导、炎症反应等多靶点及多通路的调节从而发挥抗脓毒症效应.