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目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,观察钠激活钾通道蛋白基因KCNT(potassium sodium-activa-ted channel subfamily T member 2,KCNT2)在肺腺癌癌组织中的表达及临床意义.方法 从TCGA数据库中下载肺腺癌组织的RNASeq数据以及临床数据,分析KCNT2 mRNA在肺腺癌组织和正常组织中的表达差异;以KCNT2表达水平的中位值(0.143)为界限将肺腺癌患者分为KCNT2高表达组和KCNT2低表达组,应用单因素及多因素COX回归分析癌组织中KCNT2表达与患者临床病理特征的关系及预后的相关性.应用基因集富集分析(GSEA)软件分析预测KCNT2在肺腺癌中可能的调控信号通路.结果 肺腺癌组KCNT2表达水平低于正常对照组(P<0.05);肺腺癌组织中KCNT2的表达水平与患者Stage分期相关(P<0.05);Stage分期(HR=1.947,95%CI:1.236~3.066,P=0.004)可以作为肺腺癌的独立预后因素;KCNT2低表达组生存率低于KCNT2高表达组(P=0.035);KCNT2主要参与氧化磷酸化信号通路、核糖体、嘧啶代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、谷胱甘肽代谢、RNA聚合酶等信号通路.结论 KCNT2在肺腺癌组织中呈低表达,与肺腺癌患者的预后相关,并通过参与多种信号通路促进肺腺癌的发生发展,可能是肺腺癌诊断和治疗的潜在生物标志物.

作者:刘翼;吴强;杨龙海;周孜孜;张晓明;曾薇

来源:实用癌症杂志 2023 年 38卷 2期

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作者:
刘翼;吴强;杨龙海;周孜孜;张晓明;曾薇
来源:
实用癌症杂志 2023 年 38卷 2期
标签:
肺腺癌 癌症基因组图谱数据库 钠激活钾通道蛋白基因
目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,观察钠激活钾通道蛋白基因KCNT(potassium sodium-activa-ted channel subfamily T member 2,KCNT2)在肺腺癌癌组织中的表达及临床意义.方法 从TCGA数据库中下载肺腺癌组织的RNASeq数据以及临床数据,分析KCNT2 mRNA在肺腺癌组织和正常组织中的表达差异;以KCNT2表达水平的中位值(0.143)为界限将肺腺癌患者分为KCNT2高表达组和KCNT2低表达组,应用单因素及多因素COX回归分析癌组织中KCNT2表达与患者临床病理特征的关系及预后的相关性.应用基因集富集分析(GSEA)软件分析预测KCNT2在肺腺癌中可能的调控信号通路.结果 肺腺癌组KCNT2表达水平低于正常对照组(P<0.05);肺腺癌组织中KCNT2的表达水平与患者Stage分期相关(P<0.05);Stage分期(HR=1.947,95%CI:1.236~3.066,P=0.004)可以作为肺腺癌的独立预后因素;KCNT2低表达组生存率低于KCNT2高表达组(P=0.035);KCNT2主要参与氧化磷酸化信号通路、核糖体、嘧啶代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、谷胱甘肽代谢、RNA聚合酶等信号通路.结论 KCNT2在肺腺癌组织中呈低表达,与肺腺癌患者的预后相关,并通过参与多种信号通路促进肺腺癌的发生发展,可能是肺腺癌诊断和治疗的潜在生物标志物.