目的 筛选结肠癌的关键基因,探索结肠癌发病机制.方法 从公共基因芯片数据库(GEO)搜索有关结肠癌表达的数据,利用GEO2R筛选表达差异基因,对差异基因进行Gene Ontology(GO)富集分析、 信号通路富集分析和蛋白相互作用网络构建.结果 共纳入7套结肠癌基因芯片数据,选出在≥4个数据集中有交集的差异表达基因324个,其中上调基因61个,下调基因263个.324个差异表达基因GO富集分析发现胆汁分泌、 药物代谢-细胞色素P450、 化学致癌作用等与结肠癌的发病有关.筛选得到骨形态发生蛋白2(BMP2)、CXC趋化因子配体1(CXCL1)、CXCL12、CXCL2、 胰高血糖素(GCG)、 白细胞介素8(IL8)、 基质金属蛋白酶1(MMP1)、蛋白磷酸酶2(PHLPP2)和酪酪肽(PYY)9个与结肠癌相关的基因.结论 利用生物信息学方法能有效筛选目标基因,并可为进一步研究提供依据.
作者：钟要红；何青芳；李迎君；丁烨；景方圆；范春红
来源：预防医学 2017 年 29卷 11期
