目的:对HapMap数据库四个不同人群SUMO1基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)进行分析和比较,并探讨山东汉族人群rs7599810位点多态性与非综合征型唇/腭裂(non-syndromic cleft lip with or without cleft palate,NSCL/P)的关联.方法:首先用Haploview软件确定HapMap四个人群,分别为:中国北京汉族(Han Chinese in Beijing,China,CHB)、日本东京(Japanese in Tokyo,Japan,JPT)、西北欧后裔(Utah residents with Northern and Western European ancestry from the CEPH collection,CEU)和尼日利亚约鲁巴(Yoruban in Ibadan,Nigeria,YRI),四个人群中SUMO1基因SNPs中最小等位基因频率(minor allele frequency,MAF)＞0.01且符合Hardy-Weinberg平衡的SNPs为合格SNPs,用MAF全距相对比指标衡量人群间最小等位基因相同的共有合格SNPs的MAFs差异;然后对四个人群共有合格SNPs进行单体域和单体型的分析及比较;最后对本研究所测该基因中的rs7599810在山东地区183个NSCL/P核心家系中进行传递不平衡检验(transmission/disequilibrium test,TDT).结果:HapMap提供的24个SNPs中,纯合SNPs在CHB和JPT均为9个,在CEU为8个,在YRI为6个,四个人群共有合格SNPs为12个.这些SNPs在四个人群均形成了一个单体域,

作者：岳青；王红；张博；赵凯平

来源：北京大学学报（医学版） 2014 年 46卷 2期