目的 利用生物信息学技术对骨关节炎(osteoarthritis,OA)差异表达基因进行识别和功能富集分析,并通过临床数据研究P53对基于MRI的OA间隙狭窄程度的影响.材料与方法 下载微阵列数据(GSE55235),利用GEO2R鉴别OA患者与正常滑膜样本间的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs).利用基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)对差异表达基因进行基因富集分析,进一步构建蛋白—蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析,识别重要模块,鉴定核心基因.选取50例OA间隙狭窄患者,利用MRI检测其骨关节情况,分析其临床资料,运用Pearson卡方检验、Spearman相关性分析和多因素Logistic回归进行统计学分析.结果 对照组与OA组滑膜组织之间存在差异.GSE55235的分析结果识别出91个差异表达基因.DEGs集富集分析全面概述了OA的一些主要病理生理机制:细胞对过氧化氢的反应、P53信号通路.鉴定出了4个关键基因:MMP1、CXCL8、VEGFA和JUN.与正常组对比,MMP1在OA组中高表达,CXCL8、VEGFA和JUN在OA组中低表达.Pearson卡方检验、Spearman相关性分析和多因素Logistic回归结果显示P53与OA间隙狭窄程度显著相关(OR=0.112,95％CI:0.025～0.495,P=0.004)

作者：张双；信瑞强；石逸杰；李艳翠；彭如臣

来源：磁共振成像 2022 年 13卷 6期