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目的 探讨一个腓骨肌萎缩症(CMT)家系的分子遗传发病机制.方法 抽取家系成员外周血基因组DNA,应用目标外显子捕获及二代测序技术对先证者的65个候选基因进行基因突变筛查,并对可疑基因进行Sanger测序验证.采用多序列比对分析基因序列的保守性,利用PolyPhen-2、PROVEAN和SIFT三种软件进行突变基因功能预测.用PyMOL-1软件对突变基因的蛋白质结构进行分子模拟.结果 先证者GDAP1基因第3外显子检测出1个未见报道的杂合错义突变[c.371A>G(p.Y124C)].先证者母亲及弟弟均检出该杂合突变,而其父亲未检测到该突变.多序列比对分析结果显示位于GDAP1蛋白的第124位的酪氨酸具有高度保守性.三种预测软件预测该突变均为有害突变.分子结构模拟结果显示突变体在124位的氨基酸残基与周围氨基酸残基的相互作用力减弱,影响蛋白整体的稳定性.结论 GDAP1基因突变可能与该AD-CMT家系发病有关,新发现的c.371A>G突变(p.Y124C)扩展了GDAP1基因的突变谱,但其确切发病机制仍需进一步研究.

作者:覃梨;杨灿洪;吕田明;李兰英;宗丹丹;伍月颖

来源:南方医科大学学报 2019 年 39卷 1期

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作者:
覃梨;杨灿洪;吕田明;李兰英;宗丹丹;伍月颖
来源:
南方医科大学学报 2019 年 39卷 1期
标签:
腓骨肌萎缩症2K型 常染色体显性遗传 神经节苷脂诱导分化相关蛋白1 基因突变
目的 探讨一个腓骨肌萎缩症(CMT)家系的分子遗传发病机制.方法 抽取家系成员外周血基因组DNA,应用目标外显子捕获及二代测序技术对先证者的65个候选基因进行基因突变筛查,并对可疑基因进行Sanger测序验证.采用多序列比对分析基因序列的保守性,利用PolyPhen-2、PROVEAN和SIFT三种软件进行突变基因功能预测.用PyMOL-1软件对突变基因的蛋白质结构进行分子模拟.结果 先证者GDAP1基因第3外显子检测出1个未见报道的杂合错义突变[c.371A>G(p.Y124C)].先证者母亲及弟弟均检出该杂合突变,而其父亲未检测到该突变.多序列比对分析结果显示位于GDAP1蛋白的第124位的酪氨酸具有高度保守性.三种预测软件预测该突变均为有害突变.分子结构模拟结果显示突变体在124位的氨基酸残基与周围氨基酸残基的相互作用力减弱,影响蛋白整体的稳定性.结论 GDAP1基因突变可能与该AD-CMT家系发病有关,新发现的c.371A>G突变(p.Y124C)扩展了GDAP1基因的突变谱,但其确切发病机制仍需进一步研究.