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目的:分析大黄治疗溃疡性结肠炎的有效活性化合物及作用靶点以探讨其作用机制.方法:应用中药系统药理学技术平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)数据库筛选出大黄中的潜在化学活性物质及相关靶点蛋白,采用基因组注释数据库平台(GeneCards)预测溃疡性结肠炎的作用靶点,并运用UniProt数据库查询与之相对应的基因名称,借助Cyto-scape(3.7.2)软件,构建"药物-疾病-靶点"的可视化网络图,通过STRING数据库平台构建蛋白互作网络,再利用Bioconductor平台和R语言进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析.结果:通过筛选,共获得大黄的有效化学成分16种,与UC密切相关的关键化学成分共6个,大黄-UC的共同靶点基因25个,获得PPI核心基因分别为MYC、CASP3、JUN、ESR1、PTGS2、CASP8CASP9、IL1B、CCNB1、CDKN1A、CHEK1、PPARG、BAX、NOS2、BCL2;对基因进行富集分析获得43条GO生物学过程和17条KEGG相关信号通路,涉及p53信号通路、多种凋亡通路、铂耐药通路、细胞凋亡通路、细胞周期通路、VEGF信号通路、细胞衰老通路、坏死性通路、ErbB信号通路、MAPK信号通路、NF-κB信号通路

作者:潘威

来源:西部中医药 2022 年 35卷 6期

知识库介绍

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作者:
潘威
来源:
西部中医药 2022 年 35卷 6期
标签:
溃疡性结肠炎 网络药理学 大黄 作用机制
目的:分析大黄治疗溃疡性结肠炎的有效活性化合物及作用靶点以探讨其作用机制.方法:应用中药系统药理学技术平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)数据库筛选出大黄中的潜在化学活性物质及相关靶点蛋白,采用基因组注释数据库平台(GeneCards)预测溃疡性结肠炎的作用靶点,并运用UniProt数据库查询与之相对应的基因名称,借助Cyto-scape(3.7.2)软件,构建"药物-疾病-靶点"的可视化网络图,通过STRING数据库平台构建蛋白互作网络,再利用Bioconductor平台和R语言进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析.结果:通过筛选,共获得大黄的有效化学成分16种,与UC密切相关的关键化学成分共6个,大黄-UC的共同靶点基因25个,获得PPI核心基因分别为MYC、CASP3、JUN、ESR1、PTGS2、CASP8CASP9、IL1B、CCNB1、CDKN1A、CHEK1、PPARG、BAX、NOS2、BCL2;对基因进行富集分析获得43条GO生物学过程和17条KEGG相关信号通路,涉及p53信号通路、多种凋亡通路、铂耐药通路、细胞凋亡通路、细胞周期通路、VEGF信号通路、细胞衰老通路、坏死性通路、ErbB信号通路、MAPK信号通路、NF-κB信号通路