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目的 比较早发性精神分裂症与健康人群之间基因表达差异,探究精神分裂症发病机制.方法 GEO数据库获取基因芯片数据,通过R工具进行差异表达基因分析,使用DAVID工具进行GO富集和通路分析,利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络.结果 鉴定到314个显著差异表达基因,包括221个显著上调控基因和93个显著下调控基因,基因本体GO显著富集到20个条目,主要涉及g蛋白偶联受体信号通路,嗅觉感知,磷脂酰丝氨酸酰链重构,磷脂代谢过程,钠离子通道调控激活,神经肽绑定等.KEGG通路显著富集结果主要涉及嗅觉信号传导,醚脂类代谢,长期抑制(LTD),甲状腺激素合成等6个通路.蛋白互作网络分析获得5个核心基因,模块分析结果显示得分最高的模块主要与神经肽绑定和刺激神经组织配体受体交互信号通路相关.结论 通过生物信息学方法获得了早发性精神分裂症与健康人的差异表达基因,阐释了早发性精神分裂症发病机制的相关基因及其表达特征,为早发性精神分裂症的诊断和治疗提供理论基础.

作者:胡黎丹;魏晓云;刘蜀东;李松;曾真;秦丽

来源:贵州医药 2020 年 44卷 5期

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作者:
胡黎丹;魏晓云;刘蜀东;李松;曾真;秦丽
来源:
贵州医药 2020 年 44卷 5期
标签:
精神分裂症 高通量基因芯片 差异表达基因 基因本体富集 通路富集 蛋白互作网络
目的 比较早发性精神分裂症与健康人群之间基因表达差异,探究精神分裂症发病机制.方法 GEO数据库获取基因芯片数据,通过R工具进行差异表达基因分析,使用DAVID工具进行GO富集和通路分析,利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络.结果 鉴定到314个显著差异表达基因,包括221个显著上调控基因和93个显著下调控基因,基因本体GO显著富集到20个条目,主要涉及g蛋白偶联受体信号通路,嗅觉感知,磷脂酰丝氨酸酰链重构,磷脂代谢过程,钠离子通道调控激活,神经肽绑定等.KEGG通路显著富集结果主要涉及嗅觉信号传导,醚脂类代谢,长期抑制(LTD),甲状腺激素合成等6个通路.蛋白互作网络分析获得5个核心基因,模块分析结果显示得分最高的模块主要与神经肽绑定和刺激神经组织配体受体交互信号通路相关.结论 通过生物信息学方法获得了早发性精神分裂症与健康人的差异表达基因,阐释了早发性精神分裂症发病机制的相关基因及其表达特征,为早发性精神分裂症的诊断和治疗提供理论基础.