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目的:基于网络药理学探讨绞股蓝抗动脉粥样硬化的作用机制。方法:采用TCMSP筛选绞股蓝的化学成分和作用靶点,通过人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、TTD、Drugbank、Digsee等数据库,预测和筛选动脉粥样硬化作用靶点。通过UniProt数据库查询靶点对应的基因,运用Cytoscape 3.2.1构建化合物-靶点网络、蛋白相互作用网络(protein-protein interaction, PPI),筛选出核心靶点,通过DAVID进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果:化合物-靶点网络包含13个化合物和150个相应靶点,关键靶点涉及孕激素受体(PGR)、核受体亚家族3,组C,成员2(NR3C2)、细胞核受体共激活剂2 (NCOA2)、氧化物酶体增殖物激活受体伽马(PPARG)、前列腺素合成酶1(PTGS1)、前列腺素合成酶2 (PTGS2)等。PPI网络包含131个蛋白,46个核心蛋白。GO功能富集分析得到GO条目480个,其中生物过程条目403个,细胞组成条目35个,分子功能条目42个。KEGG通路富集筛选得到25条与动脉粥样硬化相关的信号通路,涉及PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1α, HIF-1)信号通路、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路等。结论:通过网络药理学探讨了绞股蓝干预动脉粥样硬化的多成分-多靶点-多通路的作用机制特点,为进一步揭

作者:王志丹;王群;任爽;崔高翔;张杰;贾连群

来源:国际中医中药杂志 2020 年 42卷 10期

知识库介绍

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作者:
王志丹;王群;任爽;崔高翔;张杰;贾连群
来源:
国际中医中药杂志 2020 年 42卷 10期
标签:
绞股蓝 动脉粥样硬化 网络药理学 基因 信号通路 Gynostemma pentaphyllum Atherosclerosis Network pharmacology Gene Signaling pathway
目的:基于网络药理学探讨绞股蓝抗动脉粥样硬化的作用机制。方法:采用TCMSP筛选绞股蓝的化学成分和作用靶点,通过人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、TTD、Drugbank、Digsee等数据库,预测和筛选动脉粥样硬化作用靶点。通过UniProt数据库查询靶点对应的基因,运用Cytoscape 3.2.1构建化合物-靶点网络、蛋白相互作用网络(protein-protein interaction, PPI),筛选出核心靶点,通过DAVID进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果:化合物-靶点网络包含13个化合物和150个相应靶点,关键靶点涉及孕激素受体(PGR)、核受体亚家族3,组C,成员2(NR3C2)、细胞核受体共激活剂2 (NCOA2)、氧化物酶体增殖物激活受体伽马(PPARG)、前列腺素合成酶1(PTGS1)、前列腺素合成酶2 (PTGS2)等。PPI网络包含131个蛋白,46个核心蛋白。GO功能富集分析得到GO条目480个,其中生物过程条目403个,细胞组成条目35个,分子功能条目42个。KEGG通路富集筛选得到25条与动脉粥样硬化相关的信号通路,涉及PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1α, HIF-1)信号通路、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路等。结论:通过网络药理学探讨了绞股蓝干预动脉粥样硬化的多成分-多靶点-多通路的作用机制特点,为进一步揭