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目的 利用网络药理学联合GEO测序数据、分子对接技术探索大黄素治疗急性胰腺炎的潜在作用机制.方法 借助PubChem、SwissTargetPrediction、DrugBank、PharmMapper、TTD、CTD数据库获取大黄素作用靶点,通过GeneCards、OMIM、DrugBank、CTD数据库以及GSE194331数据集差异分析结果获取急性胰腺炎疾病靶点,二者取交集得到大黄素治疗急性胰腺炎靶点.使用String数据库和Cytoscape软件构建靶点蛋白互作网络,R软件ClusterProfiler包对靶点功能富集分析,Cytoscape的CytoNCA插件筛选核心靶点.使用PyMOL和Autodock软件进行分子对接和结果可视化.结果 大黄素治疗急性胰腺炎的潜在作用靶点有246个,主要涉及脂质与动脉粥样硬化、P13K-AKT信号通路、FoxO信号通路、HIF-1信号通路以及IL-17信号通路等.其中20个核心靶点与大黄素均有结合潜力,CTNNB1、HIF1A和IL1B等9个靶点与大黄素有良好的结合潜力.结论 大黄素通过多靶点、多通路发挥治疗急性胰腺炎的作用.

作者:邓弘扬;魏丰贤;马尚贤;韩伟;王满才;徐小东;张有成

来源:现代药物与临床 2022 年 37卷 6期

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作者:
邓弘扬;魏丰贤;马尚贤;韩伟;王满才;徐小东;张有成
来源:
现代药物与临床 2022 年 37卷 6期
标签:
大黄素 急性胰腺炎 网络药理学 GEO数据库 分子对接 靶点
目的 利用网络药理学联合GEO测序数据、分子对接技术探索大黄素治疗急性胰腺炎的潜在作用机制.方法 借助PubChem、SwissTargetPrediction、DrugBank、PharmMapper、TTD、CTD数据库获取大黄素作用靶点,通过GeneCards、OMIM、DrugBank、CTD数据库以及GSE194331数据集差异分析结果获取急性胰腺炎疾病靶点,二者取交集得到大黄素治疗急性胰腺炎靶点.使用String数据库和Cytoscape软件构建靶点蛋白互作网络,R软件ClusterProfiler包对靶点功能富集分析,Cytoscape的CytoNCA插件筛选核心靶点.使用PyMOL和Autodock软件进行分子对接和结果可视化.结果 大黄素治疗急性胰腺炎的潜在作用靶点有246个,主要涉及脂质与动脉粥样硬化、P13K-AKT信号通路、FoxO信号通路、HIF-1信号通路以及IL-17信号通路等.其中20个核心靶点与大黄素均有结合潜力,CTNNB1、HIF1A和IL1B等9个靶点与大黄素有良好的结合潜力.结论 大黄素通过多靶点、多通路发挥治疗急性胰腺炎的作用.