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背景:现代药理学研究表明淫羊藿苷元具有雌激素样作用,对骨关节炎的治疗起着非常积极的作用.由于淫羊藿苷元在分子水平上治疗骨关节炎的机制尚不明确,因此利用网络药理学和生物信息学从分子水平来探究淫羊藿苷元治疗骨关节炎的作用机制,可为后期药物研发及疾病治疗提供一定理论依据.目的:基于网络药理学和生物信息学初步探讨淫羊藿苷元治疗骨关节炎的关键分子机制,为骨关节炎的治疗提供新的靶点.方法:通过TCMSP数据库来评估淫羊藿苷元的药物动力学特性,检索GEO数据库中关于淫羊藿苷元和骨关节炎的相关芯片,借助R语言分析差异基因,分别构建淫羊藿苷元和骨关节炎差异基因的蛋白互作网络来明确淫羊藿苷元治疗骨关节炎的关键基因,并在淫羊藿苷元和关键基因之间进行分子对接验证,最后利用DAVID数据库对关键基因进行GO和KEGG通路富集分析.结果与结论:①淫羊藿苷元的口服生物利用度为45.41%,类药性为0.44;②检索GEO数据库获得编号为GSE85871的淫羊藿苷元芯片,利用R语言分析筛选出152个差异基因;检索GEO数据库获得编号为GSE1919的骨关节炎芯片,利用R语言分析筛选出1142个差异基因;③通过GeneMANIA数据库分别构建淫羊藿苷元和骨关节炎作用靶点的PPI网络图,利用R语言映射获得44个关键基因;④通过分子对接验证得到

作者:陈锋;章晓云;陈跃平;廖建钊;李嘉骏;宋世雷;赖渝

来源:中国组织工程研究 2021 年 25卷 23期

知识库介绍

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作者:
陈锋;章晓云;陈跃平;廖建钊;李嘉骏;宋世雷;赖渝
来源:
中国组织工程研究 2021 年 25卷 23期
标签:
骨关节炎 骨 淫羊藿苷元 生物信息学 网络药理学 GEO数据库 分子对接
背景:现代药理学研究表明淫羊藿苷元具有雌激素样作用,对骨关节炎的治疗起着非常积极的作用.由于淫羊藿苷元在分子水平上治疗骨关节炎的机制尚不明确,因此利用网络药理学和生物信息学从分子水平来探究淫羊藿苷元治疗骨关节炎的作用机制,可为后期药物研发及疾病治疗提供一定理论依据.目的:基于网络药理学和生物信息学初步探讨淫羊藿苷元治疗骨关节炎的关键分子机制,为骨关节炎的治疗提供新的靶点.方法:通过TCMSP数据库来评估淫羊藿苷元的药物动力学特性,检索GEO数据库中关于淫羊藿苷元和骨关节炎的相关芯片,借助R语言分析差异基因,分别构建淫羊藿苷元和骨关节炎差异基因的蛋白互作网络来明确淫羊藿苷元治疗骨关节炎的关键基因,并在淫羊藿苷元和关键基因之间进行分子对接验证,最后利用DAVID数据库对关键基因进行GO和KEGG通路富集分析.结果与结论:①淫羊藿苷元的口服生物利用度为45.41%,类药性为0.44;②检索GEO数据库获得编号为GSE85871的淫羊藿苷元芯片,利用R语言分析筛选出152个差异基因;检索GEO数据库获得编号为GSE1919的骨关节炎芯片,利用R语言分析筛选出1142个差异基因;③通过GeneMANIA数据库分别构建淫羊藿苷元和骨关节炎作用靶点的PPI网络图,利用R语言映射获得44个关键基因;④通过分子对接验证得到