目的:探讨桃红四物汤治疗膝骨关节炎(Knee Osteoarthritis,KOA)的作用机制,并通过分子对接进行机制验证.方法:从TCMSP和Uniprot数据库中收集桃红四物汤的活性化合物和靶点;利用GenCards和及GSE117999、GSE98918 数据集差异分析结果获取KOA疾病靶点;将药物与疾病的共有交集靶点作为治疗靶点,通过String网站构建蛋白质-蛋白质相互作用网络.运用Cytoscape软件筛选出方药-疾病的治疗核心基因并进行富集分析.最后,采用CB-Dock网站完成分子对接验证.结果:共筛选出桃红四物汤生物活性化合物 85 个,药物靶点 237 个,KOA疾病靶点 1 950 个,治疗靶点 115 个.对蛋白质-蛋白质相互作用网络进行拓扑分析,得到核心基因32 个.富集分析结果提示,桃红四物汤可能通过多生物过程、细胞组分及分子功能参与调节丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)信号通路、辅助T细胞 17 细胞分化通路等在治疗中发挥作用.通过筛选得到 5 个中心基因[JUN原癌基因(Jun Proto-Oncogene,JUN)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、连环蛋白β1(Catenin beta 1,CTNNB1)和RELA癌基因(RELA Proto-Oncogene,RELA)]和 10 个主要活性成分并进行分子对接.结
作者:石许群;王华禹
来源:中医临床研究 2023 年 15卷 11期