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目的 基于网络药理学与生物信息学研究方法,探讨小青龙汤治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)和哮喘"异病同治"的疗效及其作用机制.方法 通过ETCM数据库、DisGeNET数据库、GeneCards数据库、OMIM数据库搜集小青龙汤治疗COPD和哮喘的作用靶点.通过STRING 11.0分析作用靶点之间的相互关系,运用cytoNCA和MCODE插件筛选出核心作用靶点.使用ClueGO和DAVID数据库对作用靶点进行KEGG通路富集分析和GO功能分析.在GEO数据库下载COPD和哮喘的基因芯片,运用R语言sav包去批次效应后验证核心作用靶点是否差异表达,并对差异表达明显的核心靶点进行分子对接验证.结果 共筛选出小青龙汤治疗COPD和哮喘的作用靶点95个,筛选出19个核心作用靶点.富集分析结果显示共涉及82条信号通路及120种生物过程、16种分子功能、21种细胞组分.GEO芯片验证显示NR3C1、HSP90AA1、TNF、CASP3、AKT1、PTGS2、TLR4、EGF、IL1B、HRAS在COPD和哮喘与健康样本之间具有明显的表达差异,绘制中药-化合物-靶点网络图后,进一步对Degree值前5的靶点进行分子对接,结果显示活性成分与关键靶点有良好的亲和力.结论 小青龙汤主要通过NR3C1、HSP90AA1、TNF、CASP3、AKT1、PTGS2、TLR4、EGF、IL1B、HRAS等多靶点和TNF信号通路、

作者:翟芬芬;刘毓菲;张传涛;杨洋;黄青松;高培阳;陈新

来源:湖南中医药大学学报 2022 年 42卷 6期

知识库介绍

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作者:
翟芬芬;刘毓菲;张传涛;杨洋;黄青松;高培阳;陈新
来源:
湖南中医药大学学报 2022 年 42卷 6期
标签:
小青龙汤 慢性阻塞性肺疾病 哮喘 网络药理学 GEO数据库 分子对接
目的 基于网络药理学与生物信息学研究方法,探讨小青龙汤治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)和哮喘"异病同治"的疗效及其作用机制.方法 通过ETCM数据库、DisGeNET数据库、GeneCards数据库、OMIM数据库搜集小青龙汤治疗COPD和哮喘的作用靶点.通过STRING 11.0分析作用靶点之间的相互关系,运用cytoNCA和MCODE插件筛选出核心作用靶点.使用ClueGO和DAVID数据库对作用靶点进行KEGG通路富集分析和GO功能分析.在GEO数据库下载COPD和哮喘的基因芯片,运用R语言sav包去批次效应后验证核心作用靶点是否差异表达,并对差异表达明显的核心靶点进行分子对接验证.结果 共筛选出小青龙汤治疗COPD和哮喘的作用靶点95个,筛选出19个核心作用靶点.富集分析结果显示共涉及82条信号通路及120种生物过程、16种分子功能、21种细胞组分.GEO芯片验证显示NR3C1、HSP90AA1、TNF、CASP3、AKT1、PTGS2、TLR4、EGF、IL1B、HRAS在COPD和哮喘与健康样本之间具有明显的表达差异,绘制中药-化合物-靶点网络图后,进一步对Degree值前5的靶点进行分子对接,结果显示活性成分与关键靶点有良好的亲和力.结论 小青龙汤主要通过NR3C1、HSP90AA1、TNF、CASP3、AKT1、PTGS2、TLR4、EGF、IL1B、HRAS等多靶点和TNF信号通路、