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基于GEO数据库挖掘OLP的潜在治疗靶点,基于网络药理学分析活血化瘀方治疗OLP的主要化学成分、潜在作用靶点与治疗机制.采用R语言爬取GEO数据库中GSE52130数据集,通过差异分析得出OLP的异常表达基因;基于TCMSP数据库获取活血化瘀方中相关化学成分与靶点,利用Perl、Cytoscape软件和String绘制该药方成分-靶点网络与蛋白-蛋白互作网络;通过R语言完成关键靶基因的基因本体论(GO)分析与基因组百科全书(KEGG)分析.结果表明:活血化瘀方治疗OLP的关键化学成分共28个,包括槲皮素、山奈酚、豆甾醇等;核心作用靶点共13个,包括IL-1β、PTGS2(COX-2)、MAO等.KEGG分析发现活血化瘀方可影响神经递质代谢、巨细胞病毒感染、AGE-RAGE等通路,为后续中医药治疗口腔扁平苔藓的深入研究提供理论参考.

作者:杨倩;赖仁发;刘湘宁

来源:口腔医学研究 2022 年 38卷 5期

知识库介绍

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作者:
杨倩;赖仁发;刘湘宁
来源:
口腔医学研究 2022 年 38卷 5期
标签:
活血化瘀方 口腔扁平苔藓 网络药理学 作用靶点 治疗机制
基于GEO数据库挖掘OLP的潜在治疗靶点,基于网络药理学分析活血化瘀方治疗OLP的主要化学成分、潜在作用靶点与治疗机制.采用R语言爬取GEO数据库中GSE52130数据集,通过差异分析得出OLP的异常表达基因;基于TCMSP数据库获取活血化瘀方中相关化学成分与靶点,利用Perl、Cytoscape软件和String绘制该药方成分-靶点网络与蛋白-蛋白互作网络;通过R语言完成关键靶基因的基因本体论(GO)分析与基因组百科全书(KEGG)分析.结果表明:活血化瘀方治疗OLP的关键化学成分共28个,包括槲皮素、山奈酚、豆甾醇等;核心作用靶点共13个,包括IL-1β、PTGS2(COX-2)、MAO等.KEGG分析发现活血化瘀方可影响神经递质代谢、巨细胞病毒感染、AGE-RAGE等通路,为后续中医药治疗口腔扁平苔藓的深入研究提供理论参考.