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目的 利用网络药理学及分子对接技术分析千金藤素(cepharanthine,CEP)治疗新型冠状病毒感染的作用机制.方法 通过PubChem及SwissTargetPrediction网站检索CEP的作用靶点;在GeneCards数据库获取COVID-19的疾病靶点;将Venny 2.1.0中得到的"药物-疾病"交集靶点导入STRING 11.5网站和Cy-toscape 3.9.0软件中构建蛋白互作网络(protein-protein interaction network,PPI)分析其网络拓扑结构;通过DIVAD数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclo-pedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,预测其作用机制;利用AutoDock软件将CEP与核心靶点以及COVID-19的明星靶点血管紧张素转化酶2(angiotensin converting enzyme 2,ACE2)和SARS-CoV-2产生的主要蛋白酶(3-chymotrypsin-likeprotease,3CLpro)进行分子对接.结果 CEP与COVID-19共有40个交集靶点,关键靶点涉及Src、AKT1、EGFR、mTOR等;潜在靶点多富集在PI3K-AKT信号通路、coronavirus dis-ease-COVID-19等信号通路.分子对接结果显示CEP与ACE2和3CLpro均能紧密结合,且结合能力比指南推荐药物更佳.结论 CEP作用于COVID-19时主要通过PI3K-AKT信号通路、coronavirus disease-COVID-19信号通路调控炎性反应,大量靶

作者:黄灿;牛阳;南一;袁玲;窦红莉;姜文婕

来源:宁夏医科大学学报 2023 年 45卷 5期

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作者:
黄灿;牛阳;南一;袁玲;窦红莉;姜文婕
来源:
宁夏医科大学学报 2023 年 45卷 5期
标签:
千金藤素 新型冠状病毒感染 网络药理学 分子对接 机制研究 信号通路
目的 利用网络药理学及分子对接技术分析千金藤素(cepharanthine,CEP)治疗新型冠状病毒感染的作用机制.方法 通过PubChem及SwissTargetPrediction网站检索CEP的作用靶点;在GeneCards数据库获取COVID-19的疾病靶点;将Venny 2.1.0中得到的"药物-疾病"交集靶点导入STRING 11.5网站和Cy-toscape 3.9.0软件中构建蛋白互作网络(protein-protein interaction network,PPI)分析其网络拓扑结构;通过DIVAD数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclo-pedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,预测其作用机制;利用AutoDock软件将CEP与核心靶点以及COVID-19的明星靶点血管紧张素转化酶2(angiotensin converting enzyme 2,ACE2)和SARS-CoV-2产生的主要蛋白酶(3-chymotrypsin-likeprotease,3CLpro)进行分子对接.结果 CEP与COVID-19共有40个交集靶点,关键靶点涉及Src、AKT1、EGFR、mTOR等;潜在靶点多富集在PI3K-AKT信号通路、coronavirus dis-ease-COVID-19等信号通路.分子对接结果显示CEP与ACE2和3CLpro均能紧密结合,且结合能力比指南推荐药物更佳.结论 CEP作用于COVID-19时主要通过PI3K-AKT信号通路、coronavirus disease-COVID-19信号通路调控炎性反应,大量靶