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目的:探究复方一枝蒿颗粒治疗新型冠状病毒感染(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的分子生物学机制.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台、中医药百科全书数据库及PubChem Compound数据库对复方一枝蒿颗粒的有效活性成分进行筛选,通过基因组注释数据库平台、Drugbank、Therapeutic Target Database数据库预测COVID-19 相关疾病靶点,同时应用GEO数据库鉴定与COVID-19相关的差异表达基因.取药物活性成分靶点、疾病靶点和差异表达基因的交集,利用R语言进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,采用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用调控网络,使用Cytoscape软件构建药物-活性成分-关键靶点调控网络.此外,基于上述研究结果进行分子对接分析.结果:复方一枝蒿颗粒作用于COVID-19的有效活性成分有52个,靶标基因585个,涉及1090个疾病靶点和5882个差异表达基因,其中交集靶点基因有 30个.GO和KEGG分析结果显示,关键靶点基因主要集中在膜筏、膜微区、细胞质囊泡腔等细胞成分中,通过正调节细胞因子产生、正调控白细胞介素-8(Interleukin-8,IL-8)生成、正调控单核细胞迁移等生物过程发挥蛋白酶结合、细胞因子受体结合、泛素蛋白连接酶结合等分子功能;其主要富集于缺

作者:施洋;陈振东;赵俊芳;樊登峰;曹永宏;候宝林

来源:中医临床研究 2023 年 15卷 8期

知识库介绍

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作者:
施洋;陈振东;赵俊芳;樊登峰;曹永宏;候宝林
来源:
中医临床研究 2023 年 15卷 8期
标签:
复方一枝蒿颗粒 新型冠状病毒感染 网络药理学 分子对接 基因靶点
目的:探究复方一枝蒿颗粒治疗新型冠状病毒感染(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的分子生物学机制.方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台、中医药百科全书数据库及PubChem Compound数据库对复方一枝蒿颗粒的有效活性成分进行筛选,通过基因组注释数据库平台、Drugbank、Therapeutic Target Database数据库预测COVID-19 相关疾病靶点,同时应用GEO数据库鉴定与COVID-19相关的差异表达基因.取药物活性成分靶点、疾病靶点和差异表达基因的交集,利用R语言进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,采用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用调控网络,使用Cytoscape软件构建药物-活性成分-关键靶点调控网络.此外,基于上述研究结果进行分子对接分析.结果:复方一枝蒿颗粒作用于COVID-19的有效活性成分有52个,靶标基因585个,涉及1090个疾病靶点和5882个差异表达基因,其中交集靶点基因有 30个.GO和KEGG分析结果显示,关键靶点基因主要集中在膜筏、膜微区、细胞质囊泡腔等细胞成分中,通过正调节细胞因子产生、正调控白细胞介素-8(Interleukin-8,IL-8)生成、正调控单核细胞迁移等生物过程发挥蛋白酶结合、细胞因子受体结合、泛素蛋白连接酶结合等分子功能;其主要富集于缺