目的 肝细胞癌是常见的恶性肿瘤,而lncRNA与肝细胞癌的发生、发展有关联,目前基于癌症和肿瘤基因图谱(Cancer Genome Atlas,TCGA)的肝癌lncRNA预后模型仍有待研究.本研究旨在探索肝癌预后有关联的lncRNA,构建肝癌lncRNA预后模型.方法 从TCGA公共数据库下载肝癌的lncRNA表达谱和临床信息,筛选出肝癌组织和癌旁对照组织表达差异有统计学意义的基因.结合生存信息,筛选预后关联的基因.最后利用LASSO回归构建预后模型并验证.结果 共筛选出1 292个在癌与癌旁组织中差异表达lncRNA,其中142个与预后有关联,P<0.05.LASSO回归模型包含9个lncRNA,分别为AC0L0547.1、AC034229.4、AL121721.1、AP003390.1、BBOX1-AS1、LINC00462、LINC00942、LINC01353和LINC01954.此lncRNA模型可以很好地预测肝癌患者的生存,多因素Cox回归结果模型风险比为2.60(95%CI:2.18~3.21),Log-rank检验P=1.72e-6.结论 lncRNA模型可良好地预测肝癌患者生存,处于模型中的lncRNA也进一步为治疗靶点及预后分子标志物的选择提供了依据.
作者:张诚胜;王朝英;何二霞;徐军女;卓曼云;林海锋
来源:中华肿瘤防治杂志 2020 年 27卷 9期