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基于网络药理学方法探讨尪痹方治疗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的潜在机制.应用中药系统药理学数据库与分析平台筛选出尪痹方的化学成分及作用靶点,GeneCards数据库检索RA相关靶点,维恩图获取药物与疾病交集靶点,利用STRING数据库得到蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络信息,使用Cytoscape构建药物-有效成分-靶点-疾病网络与PPI网络图,通过DAVID数据库对共同靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析.使用SYBYL-X 2.1.1 软件进行分子对接验证.经过筛选得到 32 个有效成分及 99 个相关靶点,核心靶点为IL-6、TNF、AKT1、VEGFA、PTGS2 等.GO功能富集分析主要涉及RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控等生物过程,KEGG 通路富集分析主要涉及TNF信号通路、T细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路、破骨细胞分化等信号通路.分子对接结果显示,山柰酚、雷公藤内酯、柚皮素、川皮苷、刺芒柄花素等核心成分与IL-6、TNF、ATK1、PTGS2、VEGFA等的核心靶点蛋白之间具有良好的结合活性.本研究初步阐释了尪痹方通过多成分、多靶点治疗RA的潜在机制.

作者:王一帆;张艳艳;田财军

来源:山东科学 2023 年 36卷 3期

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作者:
王一帆;张艳艳;田财军
来源:
山东科学 2023 年 36卷 3期
标签:
网络药理学 分子对接 类风湿性关节炎 尪痹方
基于网络药理学方法探讨尪痹方治疗类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)的潜在机制.应用中药系统药理学数据库与分析平台筛选出尪痹方的化学成分及作用靶点,GeneCards数据库检索RA相关靶点,维恩图获取药物与疾病交集靶点,利用STRING数据库得到蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络信息,使用Cytoscape构建药物-有效成分-靶点-疾病网络与PPI网络图,通过DAVID数据库对共同靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析.使用SYBYL-X 2.1.1 软件进行分子对接验证.经过筛选得到 32 个有效成分及 99 个相关靶点,核心靶点为IL-6、TNF、AKT1、VEGFA、PTGS2 等.GO功能富集分析主要涉及RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控等生物过程,KEGG 通路富集分析主要涉及TNF信号通路、T细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路、破骨细胞分化等信号通路.分子对接结果显示,山柰酚、雷公藤内酯、柚皮素、川皮苷、刺芒柄花素等核心成分与IL-6、TNF、ATK1、PTGS2、VEGFA等的核心靶点蛋白之间具有良好的结合活性.本研究初步阐释了尪痹方通过多成分、多靶点治疗RA的潜在机制.