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目的 基于网络药理学方法分析芪归八味汤治疗病毒性心肌炎(VMC)的作用机制.方法 在中药系统药理学数据库与分析平台、中药分子机制的生物信息学分析工具数据库中收集芪归八味汤的化学成分和作用靶点,通过UniProt数据库对得到的靶点进行基因注释.在OMIM和GeneCards数据库中查找VMC的疾病靶点,与药物靶点进行韦恩分析,确定药物—疾病共同靶点.利用String平台对获得的相应靶点进行蛋白质相互作用(PPI)网络分析,筛选核心靶点,利用R软件对核心靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 筛选得到芪归八味汤中主要活性成分有78种,药物靶点479个,疾病靶点1058个,药物—疾病共同靶点124个.PPI网络图包括124个节点、479条边,筛选出核心靶点19个.核心靶点的GO功能富集分析得到2739个条目,在生物学过程中富集2502条路径,主要参与对细菌来源分子的反应、对脂多糖的反应、对氧化应激的反应、外源性凋亡信号通路等过程;在细胞成分中富集92条路径,主要涉及薄膜筏、膜微域、膜区域等部位;在分子功能中富集145条路径,主要涉及受体配体活动、细胞因子受体结合等方面.KEGG通路富集分析结果显示,核心靶点涉及的通路主要有糖尿病并发症中的AGE/RAGE信号通路、MAPK信号通路、肿瘤坏死因子(TNF

作者:高敏;职利琴;吴倩;郭洪兆

来源:山东医药 2021 年 61卷 11期

知识库介绍

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作者:
高敏;职利琴;吴倩;郭洪兆
来源:
山东医药 2021 年 61卷 11期
标签:
病毒性心肌炎 芪归八味汤 网络药理学 作用机制
目的 基于网络药理学方法分析芪归八味汤治疗病毒性心肌炎(VMC)的作用机制.方法 在中药系统药理学数据库与分析平台、中药分子机制的生物信息学分析工具数据库中收集芪归八味汤的化学成分和作用靶点,通过UniProt数据库对得到的靶点进行基因注释.在OMIM和GeneCards数据库中查找VMC的疾病靶点,与药物靶点进行韦恩分析,确定药物—疾病共同靶点.利用String平台对获得的相应靶点进行蛋白质相互作用(PPI)网络分析,筛选核心靶点,利用R软件对核心靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 筛选得到芪归八味汤中主要活性成分有78种,药物靶点479个,疾病靶点1058个,药物—疾病共同靶点124个.PPI网络图包括124个节点、479条边,筛选出核心靶点19个.核心靶点的GO功能富集分析得到2739个条目,在生物学过程中富集2502条路径,主要参与对细菌来源分子的反应、对脂多糖的反应、对氧化应激的反应、外源性凋亡信号通路等过程;在细胞成分中富集92条路径,主要涉及薄膜筏、膜微域、膜区域等部位;在分子功能中富集145条路径,主要涉及受体配体活动、细胞因子受体结合等方面.KEGG通路富集分析结果显示,核心靶点涉及的通路主要有糖尿病并发症中的AGE/RAGE信号通路、MAPK信号通路、肿瘤坏死因子(TNF