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目的·探讨趋化因子CXCL9(C-X-C motif chemokine ligand 9)mRNA表达水平对卵巢癌患者总体生存期的影响,挖掘其与肿瘤微环境中关键免疫相关通路及基因表达的关联性,以揭示其在卵巢癌预后的重要意义.方法·采用Kaplan-Meier法分析CXCL9 mRNA表达与癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中卵巢癌患者总体生存期之间的关系.使用基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)研究CXCL9 mRNA在卵巢癌中的生物学功能,并分析其与细胞分化抗原8A(cluster of differentiation 8A,CD8A)及免疫检查点的mRNA表达的相关性.结果·CXCL9 mRNA高表达与卵巢癌患者较好的预后显著相关.GSEA结果提示,CXCL9 mRNA富集于免疫反应相关通路.此外,Pearson相关分析显示CXCL9 mRNA表达与CD8A及免疫检查点mRNA表达呈正相关.结论·卵巢肿瘤组织中CXCL9 mRNA高表达是患者预后良好的预测指标,且CXCL9 mRNA表达可能与肿瘤组织中募集淋巴细胞至肿瘤微环境发挥抗肿瘤免疫应答功能密切相关.

作者:高境泽;吴霞

来源:上海交通大学学报(医学版) 2020 年 40卷 4期

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作者:
高境泽;吴霞
来源:
上海交通大学学报(医学版) 2020 年 40卷 4期
标签:
免疫微环境 CXCL9 卵巢癌 生物信息学分析 癌症基因组图谱
目的·探讨趋化因子CXCL9(C-X-C motif chemokine ligand 9)mRNA表达水平对卵巢癌患者总体生存期的影响,挖掘其与肿瘤微环境中关键免疫相关通路及基因表达的关联性,以揭示其在卵巢癌预后的重要意义.方法·采用Kaplan-Meier法分析CXCL9 mRNA表达与癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中卵巢癌患者总体生存期之间的关系.使用基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)研究CXCL9 mRNA在卵巢癌中的生物学功能,并分析其与细胞分化抗原8A(cluster of differentiation 8A,CD8A)及免疫检查点的mRNA表达的相关性.结果·CXCL9 mRNA高表达与卵巢癌患者较好的预后显著相关.GSEA结果提示,CXCL9 mRNA富集于免疫反应相关通路.此外,Pearson相关分析显示CXCL9 mRNA表达与CD8A及免疫检查点mRNA表达呈正相关.结论·卵巢肿瘤组织中CXCL9 mRNA高表达是患者预后良好的预测指标,且CXCL9 mRNA表达可能与肿瘤组织中募集淋巴细胞至肿瘤微环境发挥抗肿瘤免疫应答功能密切相关.