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目的 探讨益气散瘀解毒方治疗骨肉瘤的活性成分及其潜在作用机制.方法 通过TCMSP、TCMID数据库及文献检索查找黄芪、重楼、黄连3味中药的活性成分及作用靶点;利用Genecards、OMIM、TTD数据库获取骨肉瘤相关靶基因;对药物靶点和疾病靶点取交集,运用Cytoscape 3.7.2软件构建"药物-靶点-疾病网络";通过String数据库获取益气散瘀解毒方治疗骨肉瘤相关蛋白相互作用网络(PPI),利用Network Analyzer工具进行拓扑学分析;利用DAVID数据库对核心靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;利用AutoDock Vina软件将化合物与骨肉瘤相关蛋白进行分子对接.结果 筛选得到益气散瘀解毒方中的共49种活性成分,关键活性成分共23个,治疗骨肉瘤的潜在靶点93个;PPI网络分析得出益气散瘀解毒方治疗骨肉瘤的17个关键靶点蛋白,涉及Akt1、MAPK1、PTGS2和VEGFA等.GO功能富集分析得到GO条目1 720个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目1 583个,细胞组成(CC)条目30个,分子功能(MF)条目107个.KEGG通路富集筛选得到112条信号通路(P<0.05),涉及PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路等.分子对接结果显示,山柰酚、黄连素和槲皮素与骨肉瘤的Akt1、MAPK1蛋白具有较强的亲和力.结论 益气散瘀解毒方中的活性成分可能通过作用于Akt1、MAPK1

作者:尹萌辰;王洪伸;孙懿君;徐盛明;许崇卿;严寅杰;范赵翔;马俊明;莫文;施杞

来源:上海中医药杂志 2021 年 55卷 7期

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作者:
尹萌辰;王洪伸;孙懿君;徐盛明;许崇卿;严寅杰;范赵翔;马俊明;莫文;施杞
来源:
上海中医药杂志 2021 年 55卷 7期
标签:
益气散瘀解毒方 骨肉瘤 网络药理学 分子对接
目的 探讨益气散瘀解毒方治疗骨肉瘤的活性成分及其潜在作用机制.方法 通过TCMSP、TCMID数据库及文献检索查找黄芪、重楼、黄连3味中药的活性成分及作用靶点;利用Genecards、OMIM、TTD数据库获取骨肉瘤相关靶基因;对药物靶点和疾病靶点取交集,运用Cytoscape 3.7.2软件构建"药物-靶点-疾病网络";通过String数据库获取益气散瘀解毒方治疗骨肉瘤相关蛋白相互作用网络(PPI),利用Network Analyzer工具进行拓扑学分析;利用DAVID数据库对核心靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;利用AutoDock Vina软件将化合物与骨肉瘤相关蛋白进行分子对接.结果 筛选得到益气散瘀解毒方中的共49种活性成分,关键活性成分共23个,治疗骨肉瘤的潜在靶点93个;PPI网络分析得出益气散瘀解毒方治疗骨肉瘤的17个关键靶点蛋白,涉及Akt1、MAPK1、PTGS2和VEGFA等.GO功能富集分析得到GO条目1 720个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目1 583个,细胞组成(CC)条目30个,分子功能(MF)条目107个.KEGG通路富集筛选得到112条信号通路(P<0.05),涉及PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路等.分子对接结果显示,山柰酚、黄连素和槲皮素与骨肉瘤的Akt1、MAPK1蛋白具有较强的亲和力.结论 益气散瘀解毒方中的活性成分可能通过作用于Akt1、MAPK1