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目的:基于网络药理学和分子对接探讨沙参麦冬汤治疗肺癌的作用机制.方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中医分子机制生物学信息分析工具(BATMAN-TCM)数据库获取沙参麦冬汤的化学成分及靶点.借助人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DrugBank、GeneCards数据库获取肺癌相关靶点.借助Cytoscape 3.8.0软件,构建"药物-活性成分-关键靶点-疾病-信号通路"图.利用STRING平台进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,Cytoscape进行蛋白聚类分析,使用Metascape进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析并借助R语言进行可视化处理,将核心成分与蛋白进行分子对接.结果:最终得到沙参麦冬汤活性成分192个,对应靶点3585个,肺癌相关靶点1910个,药物与疾病共有靶点191个.CytoNCA显示核心靶点有JUN、MAPK8、MYC、MAPK14、STAT3、MAPK1、RELA、TP53、IL-6.GO富集分析得到2684条生物过程,117条细胞组分,210条分子功;主要富集在癌症途径、TNF信号通路、蛋白多糖在癌症中的作用、癌组织中的微RN A、铂耐药、肿瘤的转录调控失调等信号通路.分子对接显示,沙参麦冬汤主要活性成分槲皮素、豆甾醇、β-胡萝卜素、山柰酚、β-谷甾醇、柚皮素与核心蛋白STAT3、MAPK14、TP53、TNF、IL-6、MYC有较好的结合活性

作者:李桂民;李耀辉;李哲;曾璐;见婷雯

来源:世界中医药 2022 年 17卷 12期

知识库介绍

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作者:
李桂民;李耀辉;李哲;曾璐;见婷雯
来源:
世界中医药 2022 年 17卷 12期
标签:
沙参麦冬汤 肺癌 网络药理学 分子对接 作用机制 中医药
目的:基于网络药理学和分子对接探讨沙参麦冬汤治疗肺癌的作用机制.方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中医分子机制生物学信息分析工具(BATMAN-TCM)数据库获取沙参麦冬汤的化学成分及靶点.借助人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DrugBank、GeneCards数据库获取肺癌相关靶点.借助Cytoscape 3.8.0软件,构建"药物-活性成分-关键靶点-疾病-信号通路"图.利用STRING平台进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,Cytoscape进行蛋白聚类分析,使用Metascape进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析并借助R语言进行可视化处理,将核心成分与蛋白进行分子对接.结果:最终得到沙参麦冬汤活性成分192个,对应靶点3585个,肺癌相关靶点1910个,药物与疾病共有靶点191个.CytoNCA显示核心靶点有JUN、MAPK8、MYC、MAPK14、STAT3、MAPK1、RELA、TP53、IL-6.GO富集分析得到2684条生物过程,117条细胞组分,210条分子功;主要富集在癌症途径、TNF信号通路、蛋白多糖在癌症中的作用、癌组织中的微RN A、铂耐药、肿瘤的转录调控失调等信号通路.分子对接显示,沙参麦冬汤主要活性成分槲皮素、豆甾醇、β-胡萝卜素、山柰酚、β-谷甾醇、柚皮素与核心蛋白STAT3、MAPK14、TP53、TNF、IL-6、MYC有较好的结合活性