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目的:基于网络药理学和分子对接技术探究槲皮素治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制.方法:从GEO数据库选取基因芯片(GSE19188)获得NSCLC相关靶点,并与槲皮素作用靶点映射,使用Cytoscape软件构建"槲皮素-靶点-NSCLC"网络.采用STRING数据库和Cytoscape构建靶标蛋白互作网络并进行拓扑分析,运用ClusterProfiler包进行GO和KEGG富集分析.最后利用AutoDock Vina进行分子对接验证.结果:本研究共预测得到33个槲皮素治疗NSCLC的潜在靶点,利用Cytoscape中MCODE插件构建"槲皮素-靶点-NSCLC"网络和关键模块,筛选得到15个关键基因和3个功能模块.GO和KEGG分析表明核心靶点参与凋亡过程的负调控、蛋白水解等15条生物学过程,作用于癌症信号通路、TNF、PPAR、IL-17和细胞色素P450等15个信号通路.分子对接显示槲皮素与PPI中的核心靶点具有良好对接活性.生存分析显示核心基因与NSCLC患者的五年总生存率具有显著相关性.结论:本研究初步揭示了槲皮素抗NSCLC多靶点、多通路的作用机制,为槲皮素抗NSCLC研究及临床应用提供了理论依据.

作者:韩坤余;熊常州;夏雪;高朗;王怡丁;蔡政;吴继萍;牛华涛

来源:中医药信息 2022 年 39卷 6期

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作者:
韩坤余;熊常州;夏雪;高朗;王怡丁;蔡政;吴继萍;牛华涛
来源:
中医药信息 2022 年 39卷 6期
标签:
网络药理学 分子对接 槲皮素 非小细胞肺癌 作用机制
目的:基于网络药理学和分子对接技术探究槲皮素治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制.方法:从GEO数据库选取基因芯片(GSE19188)获得NSCLC相关靶点,并与槲皮素作用靶点映射,使用Cytoscape软件构建"槲皮素-靶点-NSCLC"网络.采用STRING数据库和Cytoscape构建靶标蛋白互作网络并进行拓扑分析,运用ClusterProfiler包进行GO和KEGG富集分析.最后利用AutoDock Vina进行分子对接验证.结果:本研究共预测得到33个槲皮素治疗NSCLC的潜在靶点,利用Cytoscape中MCODE插件构建"槲皮素-靶点-NSCLC"网络和关键模块,筛选得到15个关键基因和3个功能模块.GO和KEGG分析表明核心靶点参与凋亡过程的负调控、蛋白水解等15条生物学过程,作用于癌症信号通路、TNF、PPAR、IL-17和细胞色素P450等15个信号通路.分子对接显示槲皮素与PPI中的核心靶点具有良好对接活性.生存分析显示核心基因与NSCLC患者的五年总生存率具有显著相关性.结论:本研究初步揭示了槲皮素抗NSCLC多靶点、多通路的作用机制,为槲皮素抗NSCLC研究及临床应用提供了理论依据.