目的:鉴定疾病蛋白对深入理解致心律失常性右心室心肌病(ARVC)致病机制至关重要.可以采用计算生物学的方法,在ARVC疾病相关网络中挖掘新的潜在的致病蛋白.方法:本文整合HPRD和BioGRID的蛋白质互作数据,获得了较为全面且真实可靠的蛋白质互作数据；通过结合文本挖掘和统计学检验筛选出ARVC种子蛋白,应用最近邻居扩增的方法,构建ARVC蛋白质互作网络(PPIN),并采用PRINCESS法则对网络中每对互作蛋白加权；最后,基于ARVC关联得分策略对网络中的每个蛋白质打分并排秩.结果:分析发现排秩前50的候选蛋白大都与ARVC关系密切,如PRKCA,CDH1,SMAD4,SMAD2,CDH5,CTNNA1,DSC1等在调节心肌收缩、细胞程序性死亡、心脏的发育过程及维持桥粒的完整性方面起重要作用.结论:我们提出的方法为鉴定与ARVC致病机制相关的新致病蛋白提供了有效的途径.
作者：崔丹；闫玉清；李琬；陈丽娜；李为国；太京燮；张良才；宿滨；李心玲
来源：现代生物医学进展 2012 年 12卷 18期
