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目的:应用网络药理学方法及分子对接技术,探讨泽泻发挥抗炎作用的活性成分及其对应靶点和相关通路.方法:通过TCMSP筛选出泽泻的活性成分,运用SwissTarget Prediction数据库预测活性成分相关靶标,同时采用GeneCards数据库得到炎症相关靶点,再将所得的活性成分靶点和炎症靶点导入VENNY2.1 得到药物治疗疾病的潜在靶点;再运用STRING数据库、Cytoscape3.7.1 软件构建简化后的药物治疗疾病的靶蛋白互作图(PPI)并筛选关键靶点;利用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能富集分析和KEGG信号通路分析,再用Cytoscape3.7.1 软件构建"化合物-靶点-通路"图并筛选核心成分与核心靶点;最后运用Auto Dock Vina和Pymol将核心成分与核心靶点进行分子对接.结果:获得 10 个药物活性成分,得到相关潜在靶点 284 个,疾病潜在靶点 11 414 个,药物治疗疾病的相关靶点 260 个;有SRC、HSP90AA1、PIK3CA、MAPK1、AKT1、LCK、FYN、JAK1、PLCG1、JAK1 等关键靶点 58个;涉及PI3K-AKT信号通路、ErbB信号通路、FoxO信号通路等 133 条通路.结论:泽泻发挥抗炎的作用机制可能是一方面通过调控PIK3、AKT、m-TOR等相关蛋白,激活PI3K-AKT信号通路,从而抑制细胞凋亡;另一方面可能通过调控EGFR相关蛋白,介导ErbB信号通路,从而干预炎症细胞生长.本研究基

作者:缪晓冬;李才堂

来源:实用中西医结合临床 2023 年 23卷 16期

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作者:
缪晓冬;李才堂
来源:
实用中西医结合临床 2023 年 23卷 16期
标签:
泽泻 网络药理 分子对接 抗炎 分子机制 Rhizoma alismatis Network pharmacology Molecular docking Anti-inflammatory Molecular mechanism
目的:应用网络药理学方法及分子对接技术,探讨泽泻发挥抗炎作用的活性成分及其对应靶点和相关通路.方法:通过TCMSP筛选出泽泻的活性成分,运用SwissTarget Prediction数据库预测活性成分相关靶标,同时采用GeneCards数据库得到炎症相关靶点,再将所得的活性成分靶点和炎症靶点导入VENNY2.1 得到药物治疗疾病的潜在靶点;再运用STRING数据库、Cytoscape3.7.1 软件构建简化后的药物治疗疾病的靶蛋白互作图(PPI)并筛选关键靶点;利用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能富集分析和KEGG信号通路分析,再用Cytoscape3.7.1 软件构建"化合物-靶点-通路"图并筛选核心成分与核心靶点;最后运用Auto Dock Vina和Pymol将核心成分与核心靶点进行分子对接.结果:获得 10 个药物活性成分,得到相关潜在靶点 284 个,疾病潜在靶点 11 414 个,药物治疗疾病的相关靶点 260 个;有SRC、HSP90AA1、PIK3CA、MAPK1、AKT1、LCK、FYN、JAK1、PLCG1、JAK1 等关键靶点 58个;涉及PI3K-AKT信号通路、ErbB信号通路、FoxO信号通路等 133 条通路.结论:泽泻发挥抗炎的作用机制可能是一方面通过调控PIK3、AKT、m-TOR等相关蛋白,激活PI3K-AKT信号通路,从而抑制细胞凋亡;另一方面可能通过调控EGFR相关蛋白,介导ErbB信号通路,从而干预炎症细胞生长.本研究基