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通过网络药理学和分子对接技术探究生脉散治疗糖尿病及其并发症的作用机制.利用TCMSP、BATMAN-TCM、SwissTarge-tPrediction和Pubchem等数据库,结合文献检索筛选生脉散中所含有的活性成分和作用靶点,通过Uniprot数据库对靶点名称进行统一规范并找到靶点对应的基因;通过OMIM、Genecards和Drugbank数据库检索糖尿病疾病相关靶点.采用Venny2.1得到生脉散和糖尿病的交集靶点,利用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,再利用Cytoscape 3.7.2软件建立"生脉散成分-靶点"网络筛选得到生脉散活性成分治疗糖尿病的核心靶点,并对其进行拓扑学数据分析;再利用David数据库对关键靶点进行GO和KEGG富集分析,最后采用AutoDock Tools1.5.6、AutoDock vina 1.1.2软件进行分子对接结果验证.筛选出生脉散48个有效成分和352个预测靶点,糖尿病靶点1269个,韦恩图得到生脉散和糖尿病交集靶点97个,关键靶点4个,潜在作用通路3条.生脉散中治疗糖尿病的核心活性成分为豆甾醇、β-谷甾醇、尿苷和山柰酚,关键靶点是AKT1、TNF、CASP3和PTGS2.生脉散治疗糖尿病的生物学通路主要作用于TNF信号通路、HIF-1信号通路和细胞凋亡信号通路.分子对接结果显示,生脉散中的核心成分豆甾醇、β-谷甾醇、尿苷和山柰酚等与主要靶点(AKT1、JUN、TN

作者:郝秀华;张莉;赵丽颖;杜小蓉;杨锦竹

来源:特产研究 2023 年 45卷 6期

知识库介绍

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作者:
郝秀华;张莉;赵丽颖;杜小蓉;杨锦竹
来源:
特产研究 2023 年 45卷 6期
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生脉散 糖尿病 作用机制 网络药理学 分子对接 Shengmai powder diabetes effect network pharmacology molecular docking
通过网络药理学和分子对接技术探究生脉散治疗糖尿病及其并发症的作用机制.利用TCMSP、BATMAN-TCM、SwissTarge-tPrediction和Pubchem等数据库,结合文献检索筛选生脉散中所含有的活性成分和作用靶点,通过Uniprot数据库对靶点名称进行统一规范并找到靶点对应的基因;通过OMIM、Genecards和Drugbank数据库检索糖尿病疾病相关靶点.采用Venny2.1得到生脉散和糖尿病的交集靶点,利用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,再利用Cytoscape 3.7.2软件建立"生脉散成分-靶点"网络筛选得到生脉散活性成分治疗糖尿病的核心靶点,并对其进行拓扑学数据分析;再利用David数据库对关键靶点进行GO和KEGG富集分析,最后采用AutoDock Tools1.5.6、AutoDock vina 1.1.2软件进行分子对接结果验证.筛选出生脉散48个有效成分和352个预测靶点,糖尿病靶点1269个,韦恩图得到生脉散和糖尿病交集靶点97个,关键靶点4个,潜在作用通路3条.生脉散中治疗糖尿病的核心活性成分为豆甾醇、β-谷甾醇、尿苷和山柰酚,关键靶点是AKT1、TNF、CASP3和PTGS2.生脉散治疗糖尿病的生物学通路主要作用于TNF信号通路、HIF-1信号通路和细胞凋亡信号通路.分子对接结果显示,生脉散中的核心成分豆甾醇、β-谷甾醇、尿苷和山柰酚等与主要靶点(AKT1、JUN、TN