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目的 分析2010-2012年扬州地区手足口病的病原构成,并对柯萨奇A组16型(CA16)的VP1基因进行基因特征分析,了解扬州地区CA16病毒基因组VP1基因变化趋势.方法 对2010-2012年从扬州市各县市区医院采集的手足口病临床标本1 309例进行肠道病毒荧光PCR检测,挑选56株CA16阳性标本进行病毒分离培养鉴定,并对6株CA16病毒分离株进行VP1基因测序,测序后利用DNAstar7.0软件进行基因比对,构建系统发生树.结果 1309份标本中检测到372份EV71阳性,295份CA16阳性,157份其他肠道病毒阳性.56株CA16阳性标本接种RD细胞获得30株CA16阳性毒株,测定其中6株病毒的VP1核苷酸序列,其同源性为96.4% ~ 99.9%,氨基酸同源性为99.0%~100.0%,同GenBank中77株CA16参比毒株序列进化分析显示其属于B1b基因群.结论 2010-2012年扬州市HFMD的主要病原为CA16 (35.80%)和EV71 (45.15%),2011年以来其他肠道病毒比例显著上升.本地区分离CA16毒株同源性较高,与近年多数中国大陆分离株形成进化树上亲缘关系较近的一群,未出现明显毒力变化.

作者:黄瑶;周乐;巢国祥;芮明珠;毕佩佩;卜平

来源:现代预防医学 2014 年 41卷 13期

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作者:
黄瑶;周乐;巢国祥;芮明珠;毕佩佩;卜平
来源:
现代预防医学 2014 年 41卷 13期
标签:
手足口病 柯萨奇病毒A组16型(CA16) VP1基因 Hand-foot-and mouth disease Coxsackie A16 VP1 gene
目的 分析2010-2012年扬州地区手足口病的病原构成,并对柯萨奇A组16型(CA16)的VP1基因进行基因特征分析,了解扬州地区CA16病毒基因组VP1基因变化趋势.方法 对2010-2012年从扬州市各县市区医院采集的手足口病临床标本1 309例进行肠道病毒荧光PCR检测,挑选56株CA16阳性标本进行病毒分离培养鉴定,并对6株CA16病毒分离株进行VP1基因测序,测序后利用DNAstar7.0软件进行基因比对,构建系统发生树.结果 1309份标本中检测到372份EV71阳性,295份CA16阳性,157份其他肠道病毒阳性.56株CA16阳性标本接种RD细胞获得30株CA16阳性毒株,测定其中6株病毒的VP1核苷酸序列,其同源性为96.4% ~ 99.9%,氨基酸同源性为99.0%~100.0%,同GenBank中77株CA16参比毒株序列进化分析显示其属于B1b基因群.结论 2010-2012年扬州市HFMD的主要病原为CA16 (35.80%)和EV71 (45.15%),2011年以来其他肠道病毒比例显著上升.本地区分离CA16毒株同源性较高,与近年多数中国大陆分离株形成进化树上亲缘关系较近的一群,未出现明显毒力变化.