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先天性白内障(congenital cataract,CC)是一种罕见的晶状体发育异常疾病,主要表现为晶状体部分或完全浑浊.先天性白内障遗传异质性高,已鉴定的致病基因多达266个.本研究在一个中国先天性白内障家系中通过全基因组测序及Sanger测序验证,筛查到一个新的先天性白内障候选致病基因TSR1,与家系疾病表型共分离.通过minigene实验证实该变异影响TSR1基因mRNA剪接.Western blotting、免疫荧光和RT-PCR实验证实TSR1在人晶状体上皮细胞SRA01/04、年龄相关性白内障患者晶状体前囊膜组织、24周人胎眼晶状体和小鼠晶状体中表达.通过对iSyTE数据库的分析发现,Tsr1在小鼠的胚胎期和不同发育时期的晶状体中都有表达,且在晶状体特异性CBP:p300双敲除小鼠中Tsr1表达下调.提取在CBP:p300双敲除小鼠晶状体中与Tsr1具有相同表达模式的一组基因进行蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)分析,结果表明筛选出6个基因与Tsr1存在直接相互作用.GO功能分析表明Tsr1参与核糖体的组装,还可能在MAPK-Erk信号通路中发挥作用,为进一步明确Tsr1在晶状体中的功能提供了有价值的研究线索.

作者:于雅洁;邱峰;张新安

来源:遗传 2020 年 42卷 2期

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作者:
于雅洁;邱峰;张新安
来源:
遗传 2020 年 42卷 2期
标签:
TSR1 晶状体 蛋白质相互作用网络
先天性白内障(congenital cataract,CC)是一种罕见的晶状体发育异常疾病,主要表现为晶状体部分或完全浑浊.先天性白内障遗传异质性高,已鉴定的致病基因多达266个.本研究在一个中国先天性白内障家系中通过全基因组测序及Sanger测序验证,筛查到一个新的先天性白内障候选致病基因TSR1,与家系疾病表型共分离.通过minigene实验证实该变异影响TSR1基因mRNA剪接.Western blotting、免疫荧光和RT-PCR实验证实TSR1在人晶状体上皮细胞SRA01/04、年龄相关性白内障患者晶状体前囊膜组织、24周人胎眼晶状体和小鼠晶状体中表达.通过对iSyTE数据库的分析发现,Tsr1在小鼠的胚胎期和不同发育时期的晶状体中都有表达,且在晶状体特异性CBP:p300双敲除小鼠中Tsr1表达下调.提取在CBP:p300双敲除小鼠晶状体中与Tsr1具有相同表达模式的一组基因进行蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)分析,结果表明筛选出6个基因与Tsr1存在直接相互作用.GO功能分析表明Tsr1参与核糖体的组装,还可能在MAPK-Erk信号通路中发挥作用,为进一步明确Tsr1在晶状体中的功能提供了有价值的研究线索.