目的 通过生物信息学分析来确定鼻咽癌的关键途径和基因,并确定鼻咽癌增殖和发展的潜在分子机制.方法 从基因表达数据库下载了GSE64634基因表达谱.共检测16份标本,其中12份为鼻咽癌标本,4份为正常标本.随后进行了基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)路径富集分析.利用Cytoscape软件构建了差异表达基因(DEGs)的蛋白质相互作用(PPI)网络.结果 对GSE64634数据集的分析分别确定了1014个(上调191个,下调823个)DEGs.GO和KEGG路径富集分析结果显示:上调表达的DEGs主要富集于依赖DNA的DNA复制、细胞分裂、调节参与炎症反应的细胞因子的产生、抗原处理和肽抗原通过MHCⅡ类递呈和胚胎骨骼系统发育,而表达下调的DEGs主要参与纤毛运动、微管运动、鞭毛精子活力、纤毛或鞭毛依赖的细胞运动和动脉内皮细胞分化,胶质细胞增殖、趋化因子介导的信号通路.结论 对鼻咽癌数据进行全面的生物信息学分析,可用于阐明鼻咽癌发生发展的分子机制及潜在的癌症靶点.
作者:赵琳;何章彪;张欣;曹翠萍
来源:中国老年学杂志 2021 年 41卷 7期